Basic Information
Symbol
SNAP25
RNA Class
mRNA
Alias
synaptosome associated protein 25
SNAP-25
RIC-4
RIC4
SEC9
bA416N4.2
dJ1068F16.2
resistance to inhibitors of cholinesterase 4 homolog
synaptosomal-associated protein, 25kDa
CMS18
SNAP
SUP
synaptosomal-associated protein 25
synaptosome associated protein 25kDa
Synaptosomal-associated protein 25
Super protein
Synaptosomal-associated 25 kDa protein
Location (GRCh38)
20:10172395-10308258
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_130811.4
Sequence length
2053 nt
GC Content
0.4291
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-556.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-594.13 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
440.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
Synaptic vesicle membrane docking and fusion is mediated by SNAREs (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptors) located on the vesicle membrane (v-SNAREs) and the target membrane (t-SNAREs). The assembled v-SNARE/t-SNARE complex consists of a bundle of four helices, one of which is supplied by v-SNARE and the other three by t-SNARE. For t-SNAREs on the plasma membrane, the protein syntaxin supplies one helix and the protein encoded by this gene contributes the other two. Therefore, this gene product is a presynaptic plasma membrane protein involved in the regulation of neurotransmitter release. Two alternative transcript variants encoding different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
