Basic Information

Symbol
SOCS3
RNA Class
mRNA
Alias
suppressor of cytokine signaling 3 SSI-3 CIS3 SOCS-3 Cish3 ATOD4 SSI3 STAT-induced STAT inhibitor 3 cytokine-inducible SH2 protein 3 Suppressor of cytokine signaling 3 Cytokine-inducible SH2 protein 3 CIS-3

Secondary Structure

MANE Select
NM_003955.5
Sequence length
2734 nt
GC Content
0.5999

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1148.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1198.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 746.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a member of the STAT-induced STAT inhibitor (SSI), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS), family. SSI family members are cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene is induced by various cytokines, including IL6, IL10, and interferon (IFN)-gamma. The protein encoded by this gene can bind to JAK2 kinase, and inhibit the activity of JAK2 kinase. Studies of the mouse counterpart of this gene suggested the roles of this gene in the negative regulation of fetal liver hematopoiesis, and placental development. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image