Basic Information
Symbol
SOD2
RNA Class
mRNA
Alias
superoxide dismutase 2
GC1
IPOB
MnSOD
GClnc1
lncRNA-GC1
gastric cancerCassociated lncRNA 1
manganese superoxide dismutase
superoxide dismutase 2, mitochondrial
IPO-B
MVCD6
Mn-SOD
superoxide dismutase [Mn], mitochondrial
Mn superoxide dismutase
epididymis secretory sperm binding protein
gastric cancer-associated lncRNA 1
indophenoloxidase B
manganese-containing superoxide dismutase
mangano-superoxide dismutase
Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial
EC 1.15.1.1
Location (GRCh38)
6:159669069-159762529
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000636.4
Sequence length
14167 nt
GC Content
0.4153
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4434.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-4702.85 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3399.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene is a member of the iron/manganese superoxide dismutase family. It encodes a mitochondrial protein that forms a homotetramer and binds one manganese ion per subunit. This protein binds to the superoxide byproducts of oxidative phosphorylation and converts them to hydrogen peroxide and diatomic oxygen. Mutations in this gene have been associated with idiopathic cardiomyopathy (IDC), premature aging, sporadic motor neuron disease, and cancer. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 1. [provided by RefSeq, Apr 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
