Basic Information
Symbol
SORT1
RNA Class
mRNA
Alias
sortilin 1
Gp95
NT3
LDLCQ6
NTR3
sortilin
100 kDa NT receptor
glycoprotein 95
neurotensin receptor 3
Sortilin
Glycoprotein 95
Neurotensin receptor 3
Location (GRCh38)
1:109309568-109397967
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_002959.7
Sequence length
6990 nt
GC Content
0.4614
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2227.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2362.99 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1834.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a member of the VPS10-related sortilin family of proteins. The encoded preproprotein is proteolytically processed by furin to generate the mature receptor. This receptor plays a role in the trafficking of different proteins to either the cell surface, or subcellular compartments such as lysosomes and endosomes. Expression levels of this gene may influence the risk of myocardial infarction in human patients. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
