Basic Information
Symbol
SPTBN1
RNA Class
mRNA
Alias
spectrin beta, non-erythrocytic 1
Fodrin beta chain
Beta-II spectrin
DDISBA
ELF
HEL102
SPTB2
betaSpII
spectrin beta chain, non-erythrocytic 1
beta-G spectrin
beta-fodrin
beta-spectrin 2
beta-spectrin II
beta-spectrin non-erythrocytic 1
embryonic liver beta-fodrin
epididymis luminal protein 102
spectrin beta chain, brain 1
spectrin, non-erythroid beta chain 1
Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1
Spectrin, non-erythroid beta chain 1
Location (GRCh38)
2:54456288-54671446
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003128.3
Sequence length
10211 nt
GC Content
0.5031
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3431.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3609.43 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2673.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
Spectrin is an actin crosslinking and molecular scaffold protein that links the plasma membrane to the actin cytoskeleton, and functions in the determination of cell shape, arrangement of transmembrane proteins, and organization of organelles. It is composed of two antiparallel dimers of alpha- and beta- subunits. This gene is one member of a family of beta-spectrin genes. The encoded protein contains an N-terminal actin-binding domain, and 17 spectrin repeats which are involved in dimer formation. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
