Basic Information
Symbol
SRP72
RNA Class
mRNA
Alias
signal recognition particle 72
signal recognition particle 72kDa
BMFF
BMFS1
HEL103
signal recognition particle subunit SRP72
epididymis luminal protein 103
signal recognition particle 72 kDa protein
signal recognition particle 72kD
Signal recognition particle subunit SRP72
Signal recognition particle 72 kDa protein
Location (GRCh38)
4:56467595-56503681
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_006947.4
Sequence length
3855 nt
GC Content
0.3886
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1014.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1085.56 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1126.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes the 72 kDa subunit of the signal recognition particle (SRP), a ribonucleoprotein complex that mediates the targeting of secretory proteins to the endoplasmic reticulum (ER). The SRP complex consists of a 7S RNA and 6 protein subunits: SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68, and SRP72, that are bound to the 7S RNA as monomers or heterodimers. SRP has at least 3 distinct functions that can be associated with the protein subunits: signal recognition, translational arrest, and ER membrane targeting by interaction with the docking protein. Mutations in this gene are associated with familial bone marrow failure. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
