Basic Information

Symbol
STC1
RNA Class
mRNA
Alias
stanniocalcin 1 STC stanniocalcin-1 Stanniocalcin-1 STC-1
Location (GRCh38)
8:23841929-23854806 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_003155.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_003155.3
Sequence length
3868 nt
GC Content
0.4369

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1072.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1142.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 866.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a secreted, homodimeric glycoprotein that is expressed in a wide variety of tissues and may have autocrine or paracrine functions. The gene contains a 5' UTR rich in CAG trinucleotide repeats. The encoded protein contains 11 conserved cysteine residues and is phosphorylated by protein kinase C exclusively on its serine residues. The protein may play a role in the regulation of renal and intestinal calcium and phosphate transport, cell metabolism, or cellular calcium/phosphate homeostasis. Overexpression of human stanniocalcin 1 in mice produces high serum phosphate levels, dwarfism, and increased metabolic rate. This gene has altered expression in hepatocellular, ovarian, and breast cancers. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image