Basic Information

Symbol
SWT1
RNA Class
mRNA
Alias
SWT1 RNA endoribonuclease homolog FLJ20121 HsSwt1 chromosome 1 open reading frame 26 SWT1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) SWT1, RNA endoribonuclease homolog C1orf26 transcriptional protein SWT1 Transcriptional protein SWT1
Location (GRCh38)
1:185156103-185291983 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001105518.2
BLAST PRIMER
NM_017673.7
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_017673.7
Sequence length
3838 nt
GC Content
0.3799

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-952.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1030.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1229.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image