Basic Information
Symbol
SYNPO2
RNA Class
mRNA
Alias
synaptopodin 2
MYOPODIN
SYISL
SYNPO2 intron sense-overlapping lncRNA
synaptopodin-2
genethonin-2
Synaptopodin-2
Genethonin-2
Myopodin
Location (GRCh38)
4:118850688-119061247
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_133477.3
Sequence length
7282 nt
GC Content
0.4361
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2102.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2232.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1608.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
Enables alpha-actinin binding activity and filamin binding activity. Involved in positive regulation of actin filament bundle assembly; positive regulation of cell migration; and regulation of Rho-dependent protein serine/threonine kinase activity. Located in several cellular components, including Z disc; focal adhesion; and stress fiber. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
