Basic Information
Symbol
SYNPR
RNA Class
mRNA
Alias
synaptoporin
MGC26651
SPO
Synaptoporin
Location (GRCh38)
3:63228315-63616924
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001130003.2
Sequence length
2527 nt
GC Content
0.4139
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-719.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-766.9 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
741.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
Predicted to be involved in modulation of chemical synaptic transmission. Predicted to be located in membrane; neuron projection; and synaptic vesicle. Predicted to be active in hippocampal mossy fiber to CA3 synapse and synaptic vesicle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
