Basic Information
Symbol
SYP
RNA Class
mRNA
Alias
synaptophysin
MRX96
MRXSYP
XLID96
major synaptic vesicle protein P38
Synaptophysin
Major synaptic vesicle protein p38
Location (GRCh38)
X:49187807-49200218
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003179.3
Sequence length
2421 nt
GC Content
0.5816
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1035 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1075.2 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
646.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes an integral membrane protein of small synaptic vesicles in brain and endocrine cells. The protein also binds cholesterol and is thought to direct targeting of vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin) to intracellular compartments. Mutations in this gene are associated with an X-linked form of cognitive disability. [provided by RefSeq, Jul 2017]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
