Basic Information

Symbol
TBC1D8
RNA Class
mRNA
Alias
TBC1 domain family member 8 HBLP1 VRP AD3 GRAMD8 BUB2-like protein 1 vascular Rab-GAP/TBC-containing protein TBC1 domain family, member 8 (with GRAM domain) TBC1D8A TBC1 domain family, member 8A AD 3 Vascular Rab-GAP/TBC-containing protein

Secondary Structure

MANE Select
NM_001330348.2
Sequence length
4190 nt
GC Content
0.5243

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1489.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1560.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1159.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((.((((((.((((....).)))(.(((((((((((.(..((((...))))...).))))))))))).)))))))))))))..)))))(((((...)))))....(((((.((.(.(((((((((((...((((((....((((((...))))))....)))).))..)))))....)))))).).)).))))))))))((((.((....)).)))).)))))))..)).))))))))))((((((((((.(((((((((.((((..(((.((((.((((((((....(((((....(((((.(((((.(((((.......(((((((((((((((.....((((((.......))))))((((((.((.((...((((((((((((.(((((..((..........((((((((((((((((...(((((((...(((((.((((((((((....)))))))((((..........))))..))).)))))...((((.....)))))))))))......(((((((.((((((((((...((((((((((((..((((((.(.(((.(((.((((((.(((......))))))))).))).)))((((.((..((...))..)).))))......).))))))(((((...)))))(((((((((((((((.....)))).....((((((.(((((((....(((((((((.((((.((((((.........))))))(.(((((..(((((((...(((((((((.(((...))))))))))))(((((...)))))......(((((..........))))).((.(((((((..(((..((((.....)))).....))).))))))).))..((((..(((......)))..)))).)))))))..((((((...))))))))))))(((((((.........).))))))((((((((((.((((((....(((((.((...)).))))))))))))))))))..))))))).)))))))))..((((((...((.(((((.(.((..((((((..(.(((((...(((.(((..((((((..((((((((.((.......(((((..(((((.(((((....))))).)))))...)))))..)).))))).))).(((...))))))))).))).)))...))))).)..)).))))..)).)))))).))......)).))))...)))))))))))))....(((((((..((((((((..((...((((((.(((((.((.((((((((((.(((((.(..(..(((.((((..........)))).))).)..))))))...((((((.(((((((......)))))))))))))..)))))).)))).(((((((..(..((((((.((((....(.((.(((((((........))))))))).)....)))).......((....)).))))))..)..))))))).((...(((((((((((((((((((((......(((((.....((((.((.................)).))))....((((...)))).((((((.....)))))).......(((((.....((((((((((.((((((....)))))).)))..))))))))))))))))).)))))))).(((((((((((.((((((.(((.(((((((((.((((..(((..(....)..))).)))))))).((((((.((....((((....)))).)).))).)))....))))).))))))))).....((...((((.((((..(((......))).))))...))))))))))))))))).......(((....)))....((....))..((((((......))))))........((((..((((((((.(((....))))))...))))))))).)))...))))))))))..))(((((...(((....))).(((((((((((........))))))))))))))))..)).))))).))))))))..))))))))....(((......))).))))))).((((..(......)..)))))))))))))))..........))))).)))))))...)))))))....(((((..(((((....))).)).....(((((((..((((((........((((((......))))))...((((((((.(((((((.((.((((((((....((.((.((((.((.((.....((.......)).(((((((.((.((((((......((((.(((...))).))))))))))))...)))))))((((((.((((((((.((((...(((((((.((((((..(((((......((((..((((....)))).((((((((((..((((............)))).)).((((((...))))))..(((......))).........))))))))((((((.........))))))........)))).....)))))..)))))).....(((((........)))))..(((.(.(((((...))))).).)))......)))))))..)))).)).)))))))))))).)).)).)))))))))))))))).))........))))))).)))).))))))))))))))))).)))))..)))))))))).....))))))))))))))))((((((......)))))).......))..)))))((((((......))).)))(((.((((.....((((((.((((((((((((.....(((........)))..))))))....((((((((((...(((..........)))...))))))))))((((....((((.....(((.(((((........((((((..((((((((..(((((.((........)).)))))..))).....)))))))))))..........))))))))..(((((((((................)))))))))))))..))))......................................))))(((((((((((.....))))))......))))).......)).))))))...)))))))....))))..)))))))).)).)).))).))))))))))).))))).)).))))).))))).)))))....)))))(((((((.....)))))))((..(((((...(((((((((((.......)))))))))))((((.((.....((((((.(((...))).))))))..)))))))))))..))(((.(((((.(((..(((((((((((((((((((................((((..(((....)))))))))))))..)))))..))))))))....))).))))).))).........((((.......))))........................)))))))))))).)))..(((.....))).....(((((.....((((...))))....)))))....))))...))))))))).)))...............((((((..((((((.............))))))...)))))).........(((((((.(((.(((..................((((((((((((((((.((((..(((((((((....)))).)))))..))))..(((((....)))))...))))))))))))..))))...............((((..((((......))))..)))).(((((.((..(((((.((((.......)))).)))))...)).)))))..........))).)))...))))))).((((((((..(((((...))))).))))))))(((((..(((...........)))..)))))..(((((((.((.....((((((.................)))))).((((((((.......))))))))..............(((((((((.((....((((............))))...)).)))).)))))..........)).)))))))(((((((((...)))))))))..))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((.((((({.((({....}.))}(,(((((((((((.{..((((...))))...}.))))))))))),)))))))))))))..)))))(((((...)))))....(((((.((.(.(((((((((((.,.((((((....((((((...))))))....)))).))..)))))....)))))).).)).))))))))))((((.((....)).)))).)))))))..)).))))))))))((((((((((,(((((((((.((((..(((.(((,,{{{((({{.,{{((({(,{(((((((,{(((({((((({,,(({{((((,,,|||||,|}}...,(((,{{,.||||.,,,,,,{{{(((.||.((,.,((((((,,,{{{.(({{,..||.....,,,,,|(((((((((((({{{...{{{{{{{...,{{{({(({(((((((....,}}}}}|{{{{..........)))),.}||,}}}}}...((((,,,..}}}}}}||}||{,,{,.(({{{((,((({{({{(({{,{{(((((({{((..{((({(,..{{,||((.||{{{|,{.{|,,,|,}}}..}}}}|,},.))}}}|}.,|))))}}.)},.)}.},}|{|||||||||||||(((((,,,|||||(((((((((((((((.....)))).....((((((.(((((((....(((((((((.((((.((((((.........)))))),.(((((..(((((((...(((((((({,(((...))))))))))))(((((...)))))......(((((..........))))).({.(((((((..(((,.((((.....))))..,..))).))))))).)}..((((..(((.....,)))..))))}))))))}..((((((...)))))))))))}(((((((......}..),}))))){(((((((((.((((((,...{((((.{,...,).))))))))))))))))))..))))))).)))))))))..(((({(.{.((.(((((.(.((..((((((..(.(((((...(((.(((..(((((({{((((({{{.||,,,}|..(((((..(((((.(((((....))))).)))))...)))))..}}.}}}}|,|}}.{{|...)}})))))).))).)))...))))).)..)).))))..)).)))))).)),.....)).))))...))))))))))))).,{,(((((((..,|||||{{,,||..,{{{|||,|||||}|,|||||,{{{{{|{{{{,.{..|,}|||.{{||,,........|||}.|}}.}..}}}}}},|,((((((.(((((({......}))))))))))))..,,.||,.},||.(((((((..(..((((((.((((....,.{{.(((((((........)))))))}}.}....)))).......((....)).))))))..)..))))))).|}}}}||||||||{{||||{{|||||||,,,,|||||....,|{{|,{|..,,,.,....,,..,,))}}))}....{{{(,,{||||,((((((.....)))))).......||{||,,,,|((((((((((.((((((....)))))).)))..)))))))}|||,|||,|.|||||||}.{{{{{{{{{{{.((((((.(((.(((((((((.((((..((({.(....).,))).)))))))).{{((((.((....,{{|....))),.)).))).)}}....))))).))))))))),....||}}}|||{,||||,.{((......))}.)))),..}}}}}}}}))))}))}||{{,|..(((....))},.,,||,.,,||..((((((......))))))...,....((((..((((((((.(((....))))))...))))))))),|||.,,}))))}}}))|,}|||||,|||{||}|,{{|{{(((((((((((........)))))))))))})}||,,||.}}}}},||||||||,.|||||}}|....(((.,,,,,}||,|}||||}.|{{{..,......}..})}}))))}))))}}.{{{,..{{{|||,|.|||,,,|{{.,|||,,,..}}|,,||}.|||,|.}}}))).)))},,.(((((((,.((((((........((((((......))))))...(((({(((.(((((((,((.((((((((.((((((((((((,{((..,.}}}}}},{.,.{{{,.,)}}.}.,,..))))))))){{{({{{.,|{|..,,,..}},},,||,.,|||..(((((((((({,((((((((.((((...(((((((.((((((,,(({{{.....,|||{,.((((....)))).(((((((({(,.((((.,.......,..)))}.)).((((((...))))))..,{{......}},....,,...))))))))((((((.........))))))......,,|||,...,,))))}..)))))).....(((((........))))),|{{{.{.(((((...))))).).))}..,,..)))))))..)))).)).)))))))))))).}..})}).))))).)))))))).)).,......))))))),))}}.))))))))))))))))),))))),,|||||||}}}.,,.,||||||||||}||}||((((((......)))))){{....||,,,}}}}){(({,,.,,...,}|,||}((((((,({{{{{((,(((.((((((((.({((,...,)).,,.)))))))),{{{{{{....((((((((((...,{{..........})}...))))))))))((({....,{{,.,.(((,.....|||....,,,..,.{{{,||,.||||||||||}||..|||..}|}}}})),,.,}||||,,,}}))}}}}})}|,..}}},,|||||||,,.,,|,}}}}))}},.,}}))))}))}}).,}.....||},..}}))................||,.,...|}}||||,....,}}}}}(((({((((({.....))))))......))))}.,|,,...},))),)),}})}}))}}......}}||}))))))}.)).,),))),))))}))))}}{|||,}.,)}))}}},|||||.||||||..,||||,{((((((.....))))))}{|{{{(((,..{{((((((((((.......)))))))))))))}}.}}}}}},((((((.(((...))).))))))}})}))},,))))).{{((({(((((.(((..(((((((((((((((((((,.....,{{{.......,,|.,}||.....},..)}))))))..)))))..))))))))....))).))))).,,,..........,||..}}}}}).,},,,...,||,......|{,,....}))))}}}|}}}.}}}..|||.....}}},,,,.||||},},.,||||,||}},},,.,}}))}}},.))))...))))))))).}}}......|,,......((((((..(((((({{....,}}....})))))...)))))).........(((((((,(((,({(,.,..............|((((((((((((((((.((((..(((((((((....)))).)))))..))))..(((((....)))))...})))))))))))..)))}...........,,,,||||..((((......))))..}}}},{{{{{.({,.(((({.(({({{....,}))).)}}})...)).))))}..........))).}))...))))))).((((((((..(((((...))))).)))))))){|||{..|{{....,.....,)))..)))))..((((({(,{{.....((((((.........,,......)))))).((((((((.......))))))))..............(((((((((.((,...{({{............)))).,.,),))))}}}))).,.......,)},)))))))(((((((({...}))))))))..))))))).
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Predicted to be involved in blood circulation and positive regulation of cell population proliferation. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image