Basic Information
Symbol
TCEB1
RNA Class
mRNA
Alias
elongin C
SIII
transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 1 (15kD, elongin C)
transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 1 (15kDa, elongin C)
transcription elongation factor B subunit 1
TCEB1
elongin-C
RNA polymerase II transcription factor SIII subunit C
SIII p15
elongin 15 kDa subunit
transcription elongation factor B polypeptide 1
Elongin-C
EloC
Elongin 15 kDa subunit
Transcription elongation factor B polypeptide 1
Location (GRCh38)
8:73939169-73972307
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_005648.4
Sequence length
2015 nt
GC Content
0.3821
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-525.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-567.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
536.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes the protein elongin C, which is a subunit of the transcription factor B (SIII) complex. The SIII complex is composed of elongins A/A2, B and C. It activates elongation by RNA polymerase II by suppressing transient pausing of the polymerase at many sites within transcription units. Elongin A functions as the transcriptionally active component of the SIII complex, whereas elongins B and C are regulatory subunits. Elongin A2 is specifically expressed in the testis, and capable of forming a stable complex with elongins B and C. The von Hippel-Lindau tumor suppressor protein binds to elongins B and C, and thereby inhibits transcription elongation. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding two distinct isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Mar 2011]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
