Basic Information

Symbol
THRB
RNA Class
mRNA
Alias
thyroid hormone receptor beta THRB1 THRB2 NR1A2 THR1 ERBA-BETA GRTH TRbeta TRb c-erbA-beta c-erbA-2 THRbeta TRbeta1 THRbeta1 Thrbeta2 avian erythroblastic leukemia viral (v-erb-a) oncogene homolog 2 oncogene ERBA2 generalized resistance to thyroid hormone thyroid hormone receptor beta 1 nuclear receptor subfamily 1 group A member 2 thyroid hormone receptor, beta (avian erythroblastic leukemia viral (v-erb-a) oncogene homolog 2) pituitary resistance to thyroid hormone thyroid hormone receptor, beta (erythroblastic leukemia viral (v-erb-a) oncogene homolog 2, avian) thyroid hormone receptor, beta ERBA2 PRTH Thyroid hormone receptor beta Nuclear receptor subfamily 1 group A member 2
Location (GRCh38)
3:24117153-24495756 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000461.5
BLAST PRIMER
NM_001128176.3
BLAST PRIMER
NM_001128177.2
BLAST PRIMER
NM_001252634.2
BLAST PRIMER
NM_001354708.2
BLAST PRIMER
NM_001354709.2
BLAST PRIMER
NM_001354710.2
BLAST PRIMER
NM_001354711.2
BLAST PRIMER
NM_001354712.2
BLAST PRIMER
NM_001354713.2
BLAST PRIMER
NM_001354714.2
BLAST PRIMER
NM_001354715.2
BLAST PRIMER
NM_001374822.1
BLAST PRIMER
NM_001374823.1
BLAST PRIMER
NM_001374824.1
BLAST PRIMER
NM_001374825.1
BLAST PRIMER
NM_001374826.1
BLAST PRIMER
NM_001374827.1
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001354712.2
Sequence length
7576 nt
GC Content
0.4326

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2138.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2286.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2057.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((.(((((((.(((((...)))))(((((((....((((((.....))))))((((.((((((...(((..(((((((((.((((((((.......))))))))(((...))).....)))))))))..)))...((....)).))))))))))(((.((((((((.......((((((((.((((((..((((...((......)).)))).))))))))))))))..)))))))))))..(((......)))............(((.....)))..(((((((((((((.((((((.(((.((..(((((....)))))..)).))).)))))).))))........((((.....((((..(((((.((.....)).)))))..)))))))))))))).))).(((((((((((((((....(((((.(..((..(((..((((((........(((.(((...((((.(((..((((((.((((((.(((((..((..(((....(((((..((......)).))))).)))....))..))))).)...((((..((((((((((((((.((((((((..((((.((((..((.....((((.(((((...(((((((((((((((.....((((.((......)).))))))))))...))).)))))).)))))..((..((.((((((((((.(((((((((((((((((.........((((.(((.....)))...))))........(((.(((.((((((....(.(((((......))))))((((((..(((((.........(((((((.((.((...((((((.(((.(((......)))))).)))))).)).))......(((((..........)))))....((((...))))...)))))))...(((((((.(((((.((.((..........))......((((((((((((.((((((((.(((((.....)))))((((((((((....((((((((((((.(((((..(((((.((.((((((((((((.(.(((((((.((((....((((.(......).))))......(((((((((.((((((.((((((...............((.((((.....))))))(((((((..((((..(((.....(((...)))........((((((((.......))))).)))..))).))))(((((((.((((((........))))))...))))))).(((((.(((((((................))))))).))))).......)))))))..)))))))))))).))))((((........))))..)))))...)))).))))).(((((.(((((((.((((.(((((((((((((((..((((.....((((........))))..))))...)))))...).)))))...))))))))......(((((..((((((((((...)))))))))).)))))))))))))))))(((.(((........))).))).((((((........))))))))).)))))))...)))))....)).)))))..))..))).))))........................)))))))))))))))))).................((((((.......(((...)))))))))......(.(((.....))).).)))))))).((.(......).)))))))))))))).))))))))))).))).))))).)))))))))))).))).)))..)))))))..))))))).)))((((((((..(((..((...(((.((((((((((((((.((((((..(((((((..............))))))).....................))))))..))))))))..)))))).)))..))..)))))))))))((((...((.((...........)).)).)))))))))))))).))..)).......)))).....)).)))).))))..).))))))))))))).(((..((((((((((((((((((..................((.....))........)))))))))((((.(((((((....(((......)))..))).))))..))))....(((....)))...................)))))))))))).)))).))))..))))))))).......((((((((.(....(((((((((((((((((((...(((((....((((((((...(((......)))........(((((..(((((....))))))))))..(((((((((((((.(((((((((.......)))).....)))))))))).....(((((((((.(.(((...(((((............)))))........((((((((....))))))))...))).).)))).......)))))))))))))....((((((.....)))))).(((((......(((((((.......((((........)))).....)))))))......))))).........(((..(....)..)))..))))))))....))))).((((....))))((((((((..............((((......))))))))))))(((.((((((..((.((((...(((..((((((((..(((((......((((((((.((((...((.....(((((......)))))......))...)).)).)))))))))))))))))))))(((((....)))))...))))))).)))))))))))))))))).))))).))))))).....).))))))))))))))..))).))))))).)))..((((((....)))))).))))))))).))..).)))))...)))))))))....)))))))))))))......((((.......))))...............(..(((((....)))))..))))).)))..........((((((((((....(((((..(((.(((..................))))))....)))))..........(((((((........((((.((...(((.((.((((...)))).)).)))..........(((((((...............((.((((..(((((((((((((((.....(((((......)))))..)))))).....((((.((..((((.....)))).)).))))....((((((((....((((((((..((((((((........((((...(((((..(((.(((........)))...)))..)))))))))..((((((....(((.....)))..))))))(((((.......((((((....)))))).((((((.((((((.(((((.(((.....(((((....((((((((((((((((((...........(((.((((((((((((((((........((((......(((((((.(((((((......((((..(((((((..(((((.....)))))..)))))))...........((((..(((((((.(((((....((((..(((((....)))...))..))))...)))))((((..(((((.......)))))..))))....((((........(((((.((((((((((..((((....((((((....((((((......)))))).........(((((((((((.....))))..(((......)))(((((......(((((((((...((.((((((..(((....)))...)))))).))..((((..(((.((....((((............((((..........(((((.....)))))..((((......))))......((((((((((((((((.(((.(((((......))))))))....((((((((.(((...........((((((((((((..(((....)))..)))...(((((((((((.....(((..((....))..)))...(((((...))))).((((((.((((......)))))))))).)))))))))))...))))))))))))))))))))((((((((....(((((((....(((((((...)))))))....)))))))..((((((((..............(((.(((((((....)))))))..))).....((((...........))))))))))))................(((((........((((.........))))((((((((((.....((.(((((........))))).))...............((((((.....))))))...))))).)))))......(((((.((((...((((((....)))))).....)))))))))...((((((...)).))))...)))))))))))))..........)))...)))))))))))))...((((((.......))))))......))))))))....))))).))))............((((((((........((((....))))......((((((((....(((((.(((.........))).)))))..))))))))...)))))))).((((.(((((..((....))..)))))((((((.(((.(((.(((..(((((((......)))(((((((....)))))))...(((((...)))))((((.(((...(.(((((((((((((......))))))))))))).)...))))))).))))..))).))).))).))))))))))..))))))))))))))....((((.((((.....)))))))).....))))))).......)).))))..))))....)))))))))).))))).........))))(((((..(((((..((.((....((((.(((.((........)).)))...))))....))))..))).))..)))))((((((((.(.....).))))))))..(((.(((((((((((((.......)))))))(((........))))))))))))..((((((((((.........(((((((((....((((((.((....))...))))))......(((......)))..(((((((((((..............................)))))))..)))).....(((((((...(((.(((((.(((........))).))))).))).)))))))((((((((((((((((((((((((((...((((((.......((.....)).......))))))....(((((((..((.......))..)))))))...((((((((.........((((((.((((((((........((.(((.(((...(((((((((((....)))))).)))))))).))).))........)))))).)).)))).))(((((..(((((((....(((((((.((.........)).).))))))..)))))))..)))))...)))))))).((.((((((.((..((((((....(((((.((((((..(((((...))))).)))))).............))))).....................))))))..)).)))))).))))))))))))))))))))........((((((((((((.(((((...(((((....)))))..(((.(((((..(((((((....)))))))...))))))))......((......((((((((((.....(((..(((((.(........))))))....)))......)))...))))))).....))........(((((((((....)))..))))))..(((....)))..))))).))))))..))))))..((((......)))).....((((((...))))))...........(((((((.((.((....))..))))))))).((((((((((((((((((............(((((.........)).))).)))))))))......(((((((.((((((((((((((.(((...((((((((.....(((((((.....))))))).....(((((.((((((...(((((((((((((.(((.(((.(((((....))))).))).(((((((....)))))))...))).)))).)))))))))((..((((((....((((.........))))...))))))..))............))))))))))))))))))).))))))))))((((.((((((((....))))))))))))..(((((((....((((..(((((.......((((((((...((((.....)))).))))))))...(((((........)))))........(((((....)))))))))).(((((((....)))))))...((((..(((..((....))...)))..))))))))((((((....))))))..))))))).....................(((......))).))))))).))))))))))))))))..........)))))))).)))))))))........)).))))))))....)))))))..))))(((((((((((((((........)))))....)))))).)))).)))).....)))))))))))))).....))))....(((((((((((..((.((((..............)))))).)))).....))))))).))))))......)))))..........((((((........)))))).(((.....)))..))))).))).......))))))))))))..)))))))))))......)))))))))))))).(((((((....)))))))....))))))..)))))............((((((.((........))))))))....(((((....))))).))))))))..))))))))(((((....)))))......))))))))((((((......))))))..........((((.((((..((((...........))))..))))...))))))))))))).))))))...))))))))).)))).........))).......(((((((((((((...)))))....))))))))))))))))))))))(((((((((((((.....)))).))).))))))((((((((.......(((......)))...)))))))).......(((((.((((((.(((((((.((....))......)))))))(((...))).....................................)))))).)))))...))))).))..........((.(((((((((.((.....))..))))))))).))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,,((,,(({(((,,(((((...)))))(((((((,.,,,,.(((((({.((((((((((.((((((...(((.,((((((({(,((((((((.......)))))))),((...}},.....))))))))).,)))..,({....)).)))))))))))((.((((((((.......((((((((.((((((.{((((...{{......}}.)))).))))))))))))))..)))))))))).))))).}))),,)).....,...,,,{{{...,.)))..((((((((({(((.((((((.(((.((..(((((....)))))..)).))).)))))).)))}........((((.....((((..(((((.((.....)).)))))..))))))))))))))},)).{((((((((((((((....(((({.,..({..(({..((((((........(((.(((...((((.(((..((((((.(((({(.(((((..((..{{{....(((((..((......)).))))).}}}....))..))))).}.,{((((..((((((((((((((.((((((({..((((,((({,,((.....({((,{((((,,.(((((((((((((((.....((((.((......)).))))))))))...))).)))))).}))))..||,|||.||{{{{{{((.(((({((({{{{||{((,(,,,,,,,((({.(((.....}))}.,||}}...,.,..(((.(((.((((((....(.(((((......))))),((((({..({(((,,,......(((((((,{{{((.,.,((((({({..,||}}}}}.))))),.,..,,,.,..,|,.|,|.(((((........,.))))}....((((...))))...)))))))...(((((({{(((((.(,.((.....,,...}}..,...((((((((((({.{{({((((.(((((.....))))),{{(((((((,...((((((((((((,{((((..(((((.((.{{((((((((((.(,((({({{.,{(({.,,((((.{......}.))))...||.{{|||{(((.((((((.((((((..........,,,,,,(,((({.,,..}}}}},{||{{||,,||||..{{,....,{{,...}))}},,,,..((((((((.......))))).)))..,}|,||}},{((({(.((((((........}))))),.,))}}}}}.(((((.(((((((.,,.............))))))),))))).......))))}}}..)))))))))))).)))},{((........}},}}})),))...||||.|}}}|.{{(((|({(({(({{{{((((,,,,||||{((((..((((..{(({{,.........)))...))))...))))),}||.)}})}|}|||}}}|||...,,,(((((..((((((((((...)))))))))).)))))))))})))))}|(({.(((........))}.))).((((((........)))))))})})))}}}||,.}}}})....)).)))))..)},.}))})}}|..................,....,))))))))))))))))}|{,........}},....,,{,,,...,...|||...}}}}}}})).,....,.{{|,..},})),}.)))))))}.{{.|..,,,.},)))))))))))))).)}))))))))).))).))))).}))))))))))).))).)))..)))))))|.,)))}}}.|}}((((((((,.{((..((...(((.{(((((((((((((.((((((..{((((((......,,..,,,.}}}}}}|,........}...........))))))..))))))))..}))))),))}..))..)))})))))))||||...||.||,,,....,,||||.,,.}})})))))}))}}.}},.}}}},,}},}))),,,,,)).))}).))))..}.))))))))))))).(((..((((((((((((((((((..................{{.....}}.......,)))))))))((((.(((((((...,,,{.,,,..,,,..))).))))..))))....,,,....|||.......,,..........)))))))))))).))))},)))..))))))))).......((((((((.{....(((((((((((((((((((,,,(((((....((((((((...(({......}}}..,,,{..(((((..(((((....)))))))))).||||{{{..{(((|.(((({((((.......)))).....)))))))))}............({{(((((...,.,.,...,,.,{{...,,,}}...,,,,.((((((((....))))))))...||||(((|((,{(,{{{({|,(((|(((|,.,..{(((((.....,))))).|||.}}}..,,{{,........},}}|{||,..|,||}},.)))))))}},))}......}},,.,,}}..|}|||,,,.,,,))))))).))))))))....))))).,|||....,,,.((((((((..............{(((......)))}))))))))(((.(((((((,{{.((((,..(((..(((((((,.,(((((......((((((((.((((...({.....(({({,.....}))))......))...)),}).))))))))))))))))))))){((((....)))))...))))})),,))))))))))))))))),})))).))))))).....}.))))))))))))))..))).))))))).)))..((((((....)))))).))))))})).))..,.)))))...))))))))}...,)))))))))))))......((((.......)))),.......,{,,,,.{,.(((((....))))).,|||,,.))),.........((((((((((....((({{..(((.(((....,,....,,......))))))....}}}||,........{((((({{{,...,,,{{{{.,,...(((.((.((((...)))).)).)))..........(((((((...............((.((((..(((((((((((({((.,...{{|||...{,{||,,,..))))),.....((((.(({,{,......}))),.},.))))...,((((((((....((((((((..((((((((.......(((((...,(((((.(((((...,..((((((((((((,,((((((,(((...}}}|||,|||(((((((({.,({{(((,(((((({{{(((((,(((,,{{|||||{{((({(({.||,,||,|||(|(((|||.||,{||||.,(((((({,(((((((({{{{{{{{{.{{{{(,{{{{{{(({{{,..........,{{((((({(({({,,.{{({{,,{|||,{.|||||.,{{{{{{{{,..{{(((,,,,,,,,,,|||||||||,.,.|||,,,}}},,.|,..,.}})}}}},,,,,|,,|||{,.{{{{,.,}}}}})}.,||},...||||{((({..{{,,|,,,,,,,,||||{.,,,,....}}}},....,,,|{||||||||||||||}}||||,,}.|,,{,{,.,.((((((......)))))).,,.||{|||||{|||({{{.....}}}}..,,|,|,..{(((({{((.(({..((((,......,}}}|.||||.}|||}}}}}))...)))))).))))),}.,}}}}}|,,,.}}}})))).}}}}}}}}||,,|,........(((((.....)))))..,|||.}||,{{||.,|,,..((((((((((((((((,(((.(((((..,,,,|||}|}}}....((((((((.(((...........((((((((({((..(((....)))..))}...(((((((((((.....,,{..((,,,.,,..)})||.(((((...))))).|(((((.((((......))))))))))})))))))))))...)))))))))))))))))))){{((({{{,.,,(((((((....(((((({...}))))))....))))))).,((((((({,.......|,....{{{.(((((((....))))))).,}}},,.,.{{{{...........)))))))))))}..,,.....,{{{{.,{|{{{........{(((.........)))}{(((((((((.,...((.(((((.,....,.))))).)).............,.((((((.....)))))).}.))))).)))))..,}}}|{{,((((((...((((((....))))))...,.))))))}||,..{(((({,,.,},}|}}...})),.})))})}|..........}},,.,})))))))))))),,},,)))).,,.)),)))))},}))))).)))})},.})))),,..((((((((.....)))))))){({{{.((({((((....,,,.......,(((((((....(((((.(((.(......,))).)))))..)))))))|,,,.{{{{(((({.(({(((((,,((,,,,}|,,|||}}.|{{(({{{{.||{|,|,...,.|||,...}}})))|{(((((....))))))}...(((((...))))),}|}.))})}))))|)})}||(({{.{(((.{{,.(((((((.((((.{{{....,.,.|(((({|{{|||.....})).)))})}},,...(((((.{,,{{{..,{((.((((.....))))))))})}.))))).})}..))))))))))).}))))}.,}),,,.)))))))),,,}))}}....,|,|({(({,{{,,,({{(,,((,{,.({,{{(,{{,|....,,..}}|||}.,.||||}.}}))}}.,}}}.|||||(|(|((((((((.{.....}.)))))))).,))}))),)))||{{{{,......,))}))))}}.}},..,,,.|((|{....))))|(((((((((..,,.....((((((((({{(.((((((.((....))...))))))......,{,,{{{,{{{{..{{{{|||{{{{..,,.......,,{{.........,.,,..}}|||},..))))....,|||{|{({{.((({(,,,|}|||..,,,{{{|||{|||||,|||{||||}}},,|||||{((((((((((((((((({...((((((.......((.....)).......)))))),((({.,..(({|,{((((..(((.{((({.((((((...((((.,..({...}}..,.))))..))))))........{{,.,{({{.(((((((((((....)))))).))))).))})}|{{(({{({(({{{{.{((({.....}}}}|..,..,||,,.,.,..,|}},,}}))))))).,,,,.,,,}}},))))).)))..))))),))}}..,.}))),((.((((((.((,.((((({....{((({.{{((({..(((({...,}}}}.})))))..}}},,......})}},.....................,,}},,..)).)))))).)))))))))))))))))))),,{{{....,,,,|||||{{.(({{,...{((((....}}}}|..(((.(((((.,(((((((....))))))).,.)))))))).}}},,||}}....((((((((((....,(({..{{{({{(.....,,.})))))....)))......}})...))))))).....,,........((((((({(,,..}))}.})))))..,,{.,.|}}}..})))).))}})}.}))))))}.{{{{,....,}}}|{{....|||,,,|{{|||,,.....}}})},((((({{{((.((....))..))))))))).((({((((((({{{((((,,,..,,{{,.,((((,.........,}.,,,.)))))))),,,,,,.{((((((.((((((((((((((((((...(((((((({..,{(({{{{{....,|||}}}}}},...,,,,.{{({{{...({{{{{(((((((.{({.(((.(((((....))))).))).(((((({....}))))))...}}},)))),)))}}}}||{{..{{{{{{...,||||...,...,.}}))...)))}}}..}},,.,,,......)))),)))}}))))))))).)))))))))){(((.((((((((....))))))))))))..,,,{{{,.,,|({(({,(((((.......((((((((...((((.....)))).)))))))).,,(({,{.......,)))}}........{{(({....))))}})))).{((((({....})))))),,,,,{|..,,,..{{,,,,}}...,}).||}...,,}|{{{({..,.},}|||{{||,,,)),},,,..}}}....,..,,,,,.......,}}}.))))))).)))))))))))))))),,,...,,,.,,,,}))).)))))))))........)),})))))),.....,,||,||(({(,((((((((((((({(.,......,)})}}}}.))))))))))).))))...,,,{{{(({...,.......,(((..((((((..((.....))..))))))..)),,,.....,}}},.))))),.,,.{{{{|.||||||,....}},.}}})},,},}},..((((((........))))))..||}}}}})),...,,,}}}}},,..,.,((((((,{{.(((((.(((({.(({.,{.(((((......))))).}))))))))..)))))))...))))))}....))))))))))))..,,...)))))})}..},}}.,.)))))...{((((....))))}.))))))))..))))))))(((((....)))))......))))))))|(((((......)))))}......,,..,{||,,{{{..((((...........))))..}))}...)),)))))))))).))))))...))))))))).}))),,,..,}.,))},......(((((((((((((...)))))....)))))))))),.))))))))))(((((((((((((.....)))).)))}))))))|{{{(((({{,{,,,,,..{,....}}...|,||||||{.{,,{{((((,.,,,..{,(((((((.{{....,,......))))))){((...))}...............,.)}}))}..}},})))))))||}},}}|}}}...,.}))))}}}}},}},.,,|||.{((((((((.{{.....))..))))))))},.)}}.},..,}...
Summary

The protein encoded by this gene is a nuclear hormone receptor for triiodothyronine. It is one of the several receptors for thyroid hormone, and has been shown to mediate the biological activities of thyroid hormone. Knockout studies in mice suggest that the different receptors, while having certain extent of redundancy, may mediate different functions of thyroid hormone. Mutations in this gene are known to be a cause of generalized thyroid hormone resistance (GTHR), a syndrome characterized by goiter and high levels of circulating thyroid hormone (T3-T4), with normal or slightly elevated thyroid stimulating hormone (TSH). Several alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image