Basic Information

Symbol
TLK1
RNA Class
mRNA
Alias
tousled like kinase 1 KIAA0137 PKU-BETA tousled-like kinase 1 serine/threonine-protein kinase tousled-like 1 SNARE protein kinase SNAK serine threonine protein kinase Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1 PKU-beta Tousled-like kinase 1 EC 2.7.11.1 EC 2.7.11

Secondary Structure

MANE Select
NM_012290.5
Sequence length
5723 nt
GC Content
0.4014

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1475.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1589.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1444.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.........)))))(((((((((((...((.....)).(((((....((((((.(((((((((..((......(.(((((.((((((.(((...))).(((((.(((((...((...((.(((((.((((.......)))).(((....)))...)))))))...))...))))).))))).)))).)).))))).)......)).)))))))))))))))...((......))...((((((.........((((((.(..((.((.(((.((...(((((((.(((((........((((((((((((.(((((((((.((..((((((((((((((.(((...(((((((..(((.((..(((((.((((((((.((.((((((.(((((....((((......))))))))).))))))..)).)))).)))).)))....))..)))))..)).)))))((((.........)))).))).)))))))..(((.(((((((((.(((((((((...(.((..(((.((((((((.(((((((......((......))......)))))))..)))...))))).)))..)).)...)))).))))).........))).)))))).))).)))))))..))...((((.....))))........)))))(((((((.((.(......).)).)))))))))))...)))))..............(((((((((........)))).)))))((..(((((..((........)).)))))..)).))))))).......(((....))).))))).)))))))...))..........))).)).))..).)))))).........)))))).)))))..((((((........)))))).......))))))...)))))........(((.((((....)))).))).....(((((..............((((((((.((((.((((((((((((((.(.(((..((((((((((((...(((....)))...)))))...(((((((((.........)))))...(((((............(((..(((...(((((((.......)))))))))).))).......(((((...)))))...)))))))))..(((.........)))..))))))).(((......))).)))).)))))))...(((((.....((((((...(((.(.......))))...))))))....((((((((.(((...))))))))))).....(((((((...(((((..(((((((((((((.((((((((((((.(......(((...)))((((((((.((((..(((.....((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))...(((((....(((...((((.(...(((...(((.(((....)))...))).....))).).))))...))).............))))).......)))))))).))))))...............)))).)))))))).((((.((.(((((..(((.((..((((((.......(((((((..((.....))..)))...))))....)))))))).)))..))....)))))))))..((((((.(((((......(((((((((...(((((((.((..((((........))))..)).))))((((((..............((((.....))))))))))..................((((((.....))))))...))))))))))))((((((((((((((..........)))))))....)))))))........((((((((((((((......)).)))).........(((((.(((((.((((((...((((((.....((((((((((((((((((((((((............((((......)))).....(((((.((((((((.((((((..((((.((((((.....)))))).(((((((.(((.((((....(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))...))))))).))...)))))............((((((((...................))))))))....((((....))))(((..((((.((((....(((.(((...((((..(((..(((((((((.....)))))))))..)))..)))).(((((((((((.((.((((.(((((.......((((((((.((.((((.(((((((((.......(((((((((((.((((((((..............)))))))).((((((((........((..((((....))))..)).(((.((..(((((.....)))))..)).))).))))))))..))))))))))).......))))))..............))))))))).))))))))......(((((((((((((((..((....))..........)))))))).))).))))......))))).)))).)).)))))))..)))).............(.(((((.((((((..(((((......)))))(((((((((.((((((((((((.((....)).)))......((((((.(((..........(((((((((.(((((.(((((((((((((((((..........(((((.(((((..........))))).)))))((((((((((.........................((((((((((((((.....)))....((((((((((((....((..(((.(((((..(((((((((((((((.((((.((.(((((((.(((.((((((.((.(((((((........(((.(((((((((((((..(((...(((((((...((((((.((...((......(((((((.((((....)))).)))))))..))...((((((.......(((((.......))))).(((((((((.(((((....(((((...((((....((.((((((........)))))))).(((((..(((((...)))))))))).)))).)))))...((((.((((.......))))))))(((((((.....)))))))......))))).)))))))))))))))....)).))))))...))))))).(((((((((.((.(((..((((..((((((((((..........)))).....))))))..))))))).)).)))....)))))))))..))))))))))))).)))..((((((((((((.((((.......)))))))).).)))))))(((.(((((...))))).)))......((((((..((((.(((......)))...))))..))))))..))))))).)).......)))))))))..))))..))))))))).)))))....))))))))))))))).)))))...))))).)))))))....(((((..........((((((((((((.((((((..((((((((......((.((((((...((((..((((((((((((.......(((((((.((...((((((((((((....(((((((...(((.....(((((((....)))))))))).)))))))((.((........)).)).....................(((.((((((.((((..(((((((((((......((((((((..((((.....(((.((((((..(.((((((..(((.((((...)))))))((((((.........)))))).......((((((((.(((((((..(((.((.((.(((((...))))))))))))....))))))).))))))))......((((((((..((((..(((((((.......)))))))...((((((((((...(((((((....((((.....((((((....))))))))))..)))))))...)))).)))))).........(((((((.....)))))))........))))..)))))))).)))))).)..)))))).))))))).......(((.......)))..........)))))))))))))))))))..))))))))))..)))..)))))))...)))))..))))))))).(((((...))))).........)))))))))))))))).)))))).))....))))))))..))))))..))))).(((((((............))))))).)))))))(((((...(((((((((...((((((...((((........)))).....((((((((..((((.......(((((((......)))))))))))..))).)))))....)))))).)))....))))))...)))))......(((((((((....(((.(((((((.....))))))).))).....))).))))))...((((((.....))))))..)))))..)))))))))))((((....))))((((((.(((((((..(((((((.(((.....(((.....)))))).)))))))....)))).))).))))))((((((((((.(((......))))))))))))).))))))))))(((((........))))).....)))))))))...)))))))))))))..((((((...............))))))....))))))))).(((((((...............)))))))...........(((((......)))))(((.(((((...)))))..))).))))))))).......)))))))...)).))..).))))))((((((....))))))..................)))))).))))).).............))))))...)))).))))..)))...)))))))))))))))))).))))).......((((..((((.....)))).....))))....(((..((((((...))))))..)))....(((.(((((...((......))))))).))).)))).))))...(((((....)))))))))).))).....).)).))))).......))))))....)))))).)))))))))).((((....)))).....))))))))(((((((.....)))).))).....))))))))))).......)))...)))).))))))))..........).))))))))))..........)))))))))).)))))....)))))..))))))).))))).)))))))..))))..........(((((((....)))))))((..((((((...(((((((.(((.(((((.(((((.........))))).))))).))).)).)))))..))))))..))..........(((((.......))))).....))))))))....((((....................)))).)))))..((((((((((......((.....))......)))))))))).(((.((((((((((...))).))))))).))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.........)))))(((((((((((...{(,,,,{{,{({{{{....{{||||.||{||||((,.((.{....{.{({((,((((((.((,.,,{,,.{((({.(((({..,((,.(((((,,,..||||,,.},..))))}|||....))),},}))))))}}}.},.,)},)).}}})),|}}|,||.||}},........,,.}}}}})))))))}}),..{{......||,.,((((((.........((((((.(..((.((.(((.,,...(((((((.(((((........((((((((((.(,(((.{{{,{,({,,((((((((((((((.(((,,.{(((((({{((({{{.,(({(({((((.((((((.,....,.)))))).}}|((,{{{...||||||||{{|||.,}|.}|||}||{|,||{||,.,......|,,||||}},}}}}}||,,.}},.}}.||}},.}}}.)))||||,,({{.{{{{||||||{{|{{||||,|.|,||..|||,{{|{{|||,||||||||,..|}|.,,.}}}),..,...}})}))}..}}}|,.}}))).)))..)).),..)))).)))}|....,,,,|||.,||||}}.}}}.,,}))),,,))}..||||},,..,}))}}}},},})})))}|{,{{{..,,,.,})}),{|||,..((((((.((....)).}))))}...,,,..{((((((((........)))),,))))}}},(((({.......}}}}}...,)))).)))}})))))).......(((....))).))))).)))))))...,}..,.......))).)).))..).))))))....,....)))))).)})))..((((({.,,.....)))))).......))))))...)))))........({{.((((....)))).))).....{{{{{........,{{{{{((,,,,{{.((((.((((((((((((((.(.(((..((((((((((((,..(((....)))...||||,...}}}||{(({.........|}}}|..,{{{{{.....,,,,...(((..(((...(((((((.......)))))))))).))).,,,...(((((...)))))...},))))))|,.{{{.....,...}))},))))))).(((......))).)))).)))))))},.(((({.....{{((({...,,,.,.......,}}}...}})))}....((((((((.(((...))))))))))).....(((((((...{((((..((((((((((((((({((((((((((.{{{{{..(((...}||,{{{{{((,((((,.,...{{{{((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))}..(((((..,.(((...((((.(...,{(...(((.{((,,..})),,.))).....}},.,.))))...))).............))))).......,))))))).))))))...............)))).)))))))).({{,,,..,,.}|||{,,.,.,||,..||,.,,.,,,}||||,{((((((....((((((.....{({,{....})))...{{{{{..((((((((((..........((((((((...(((((.(({.{,,..((((.((..((((........))))..)).)))),,,{.(((((.(((((((..((((((.,....((((((((((((({{{(..,,,,..(((({{.....))))}}..((((((((({,(((((.((((((((.((,.,(((((((((((..(((((.(((,.{{,....{((((({(((.((({....}})}.}|||,,.....,}}}}((((((((((..{,,.,,..{((({........((((((....)).))))...............((((......))))..})))}....}}}.,..))))))))))..,,.{(((((.....)))))|{((((({{.{||,||||,...(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))..,}))))}).))...))))}..,})))))},..))).)))))..,),..})))))))).,.,.)).)))))}.......))))))))))))))))).....|}}|}|}}|.((((..(((..(((((((((.....))))))))).,)))..)))}{(({,(((((((.((.((((.(((((..,,,..((((((((.((.((((.(((((((((.,.....(((((((((((.((((((({..............|))))))).{(({{(({...,,,,.||..((({....))})..,,.(((.((..(((((.....)))))..)).))).})))))))..))))))))))).....}.))))))..............))))))))).))))))))......(((((((((((((((,,((....)).,,.......)))))))),})).))))....,.))))).)))).)).)))))))||||||...,,,.,,....,.(((((.((((((..(((((......))))){(((((,{{.{,((((((((((.((....)).)))......((((((.(((..{{,,,.,,(((({((({,(((((.(((((((((((((((((.....,.,..{(({{.{((({|,,,,{{{{,||,}}.},}})}||||||||,.,.................,,,,,,{{{{{{{,,,,(((.....))){,..(((((((((((({...{{..(((.(((((..((((((((((((((,.((((.{{.((({(((.{{{.((((((.{{.(((((((........(((.(((((((((((({{{({{,,((((((.......))))))....{{,,,,..{((((((.({{{....}))).)))))}|,|{|,..{(((((,,,,.,.{{{{{,......}},,,.(((((((((.(((((....(((((...{(((,{(((,,{{{({({{{,{{{,.........{{{{,||{{{{{...))))))))),.}}}}.}}}}}..,((({,((((.......)})}))}|{((((((.....))))))}......))))).)))))))))}}}}}|,||.,|||({(((,..{|,||||.,,(((((((((.((((,....((((((((...))))))))....}...)))).)))))))))...,}},)}}}},.}}}.))))})))},})))))))))))).)))..{(((((((((((.((((.......)))))))).).))))))},{,.,{{{{..,}},}}}}}},.....((((((..((((.{{{......}}}...))))..))))))..))))))).}}......,)))))}}))..)))),.)))}})))).,))))....))))))))))))))).)))}}..,))))),,))))))..}}{((({..........((((((((({{{.{(((((..((((((((......({.((((((...((((..{(((((((((((.......(((((({{((...(((({(((((((...,{(({(({...({{....,(((((((....))))))||||.}}}}}}}|{,{{........}}.||......}}....,.,,....,|,|,((({{{{((((.,(((((((((({.....,((((((({.,(,{{.{{{.(((.((((((..(.((((((..(((.((((...}))))))((((((.........)))))}....,,.((((((((.(((((((,.(((.((.{{.(((({...}))))))))))),,..))))))).))))))))...,,.((((((((..(((,..(((((((.......)))))))...((,((,{{((...,||||{|}.,}{,{{,,,,.(((({,.,,,)}})))}}},..,,,,,||.{((((.,.||.....}},))))){||{((,....}}}},}..}}},,,,})))..)))))))).)))))).)..)))))).))))))}.......(((.......)))..,...,}),))))))))))))))))))),}))))))))))..}},..)))))))..,}))),..))))))))).(((({...})))).........)))))))))))})))).)))))).)}....))))))))..)))))}..}))}..{((((((............)))))))})))))))(((({...(((((((((...((((((...{(({....,}},,}},.....((((((((..((((.......(((((((......)))))))))))..))),,)))).,..)))))).)))....}))))).,.}))))......{((((((((..,.(((.(((((((.....))))))),))},....))).)))))}...((((((.....))))))..)))))...}))))))))}{(({....))))((((((.(((((((..(((((((.(((.....(((.....)))))).)))))))....))))}))).))))))((((((((((.(((......))))))))))))).,,}}}},,,.{((((........))))).....)))))))))...)))))))))))))..{{||||,,.}}},,..,},..}}}}})}}},})))})))}.(((((((...{,........}}))))))).......,..|{((({......))))}(((.(((((...)))))..))).))))))))).......)))))))...}}.,}..,.)))))|((((((....))))))}.,.,,,...........)))))).))))),|,,,{{,,,,,((({.|||.,{{{,,,.||||.|||||{{.....}}}|{(((({.,,......)))))))((((,,((((.....)))).....)))),...(((..((((((...))))))..)))........,||||,,.,,......)))))))||||,}},}}},,,.,.}}}}}}},.,||||...})}).)))))))).))))),.))))))..)))))))).))))).),))))))))..)))).))))........}).))))))))..,,.}}}}))))))))))))))...(((((.....))))),,.))}))).}}}}))))..,}}}....}.))))))))))..,.......)))))))))).)))))....)))))..))))))).})))).}})))))..)))),.|,,.....(((((({....}))))))((..((((({...((((((({({,.(((((.(((((.....}}})),)))))}},..))).}}.})))),,))))))..))..........(((((.......))))).....}))))))}....{{{,,{{{,..,}}|.||....,,|||},|}}}}..((((((((((......,{.....})....,.)))))))))).|({.(((((({|,,...,}}.))))))).))).))).
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine kinase that may be involved in the regulation of chromatin assembly. The encoded protein is only active when it is phosphorylated, and this phosphorylation is cell cycle-dependent, with the maximal activity of this protein coming during S phase. The catalytic activity of this protein is diminished by DNA damage and by blockage of DNA replication. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image