Basic Information
Symbol
TLR1
RNA Class
mRNA
Alias
toll like receptor 1
rsc786
KIAA0012
CD281
toll-like receptor 1
TIL
TIL. LPRS5
toll/interleukin-1 receptor-like protein
Toll-like receptor 1
Toll/interleukin-1 receptor-like protein
CD281 antigen
Location (GRCh38)
4:38787555-38856817
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003263.4
Sequence length
2851 nt
GC Content
0.3914
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-720.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-778.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
788.3
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene is a member of the Toll-like receptor (TLR) family which plays a fundamental role in pathogen recognition and activation of innate immunity. TLRs are highly conserved from Drosophila to humans and share structural and functional similarities. They recognize pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) that are expressed on infectious agents, and mediate the production of cytokines necessary for the development of effective immunity. The various TLRs exhibit different patterns of expression. This gene is ubiquitously expressed, and at higher levels than other TLR genes. Different length transcripts presumably resulting from use of alternative polyadenylation site, and/or from alternative splicing, have been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
