Basic Information
Symbol
TLR4
RNA Class
mRNA
Alias
toll like receptor 4
hToll
CD284
TLR-4
ARMD10
toll-like receptor 4
TOLL
homolog of Drosophila toll
toll like receptor 4 protein
Toll-like receptor 4
CD284 antigen
Location (GRCh38)
9:117704175-117724735
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_138554.5
Sequence length
12677 nt
GC Content
0.3914
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3421.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3673.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3190.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene is a member of the Toll-like receptor (TLR) family which plays a fundamental role in pathogen recognition and activation of innate immunity. TLRs are highly conserved from Drosophila to humans and share structural and functional similarities. They recognize pathogen-associated molecular patterns that are expressed on infectious agents, and mediate the production of cytokines necessary for the development of effective immunity. The various TLRs exhibit different patterns of expression. In silico studies have found a particularly strong binding of surface TLR4 with the spike protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the causative agent of Coronavirus disease-2019 (COVID-19). This receptor has also been implicated in signal transduction events induced by lipopolysaccharide (LPS) found in most gram-negative bacteria. Mutations in this gene have been associated with differences in LPS responsiveness, and with susceptibility to age-related macular degeneration. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
