Basic Information

Symbol
BAZ2B
RNA Class
mRNA
Alias
bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B WALp4 bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B KIAA1476 Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B hWALp4
Location (GRCh38)
2:159315312-159617282 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001289975.1
BLAST PRIMER
NM_001329857.2
BLAST PRIMER
NM_001329858.2
BLAST PRIMER
NM_013450.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_013450.4
Sequence length
8145 nt
GC Content
0.4001

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2038.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2196.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2058.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001329857.2 ACUUGGUUCAUGAAGCCUUCGCCUAGAAGUGAAGCUGCUGAACAAACCU… 8088 nt 0.3990
NM_001329858.2 ACUCCCCGGCUUGGGCCUCUAGCUCUCCCGUGUGUAGCUGGAGGCUCUG… 7935 nt 0.4018
NM_013450.4 ACUUGGUUCAUGAAGCCUUCGCCUAGAAGUGAAGCUGCUGAACAAACCU… 8145 nt 0.4001
Summary

This gene belongs to the bromodomain gene family. Members of this gene family encode proteins that are integral components of chromatin remodeling complexes. The encoded protein showed strong preference for the activating H3K14Ac mark in a histone peptide screen, suggesting a potential role in transcriptional activation. This gene may be associated with susceptibility to sudden cardiac death (SCD). [provided by RefSeq, Aug 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image