Basic Information
Symbol
TMEM165
RNA Class
mRNA
Alias
transmembrane protein 165
TMPT27
TPARL
GDT1
SLC64A1
TPA regulated locus
CDG2K
FT27
putative divalent cation/proton antiporter TMEM165
transmembrane protein PT27
transmembrane protein TPARL
Putative divalent cation/proton antiporter TMEM165
Transmembrane protein 165
Transmembrane protein PT27
Transmembrane protein TPARL
Location (GRCh38)
4:55395652-55453397
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_018475.5
Sequence length
1931 nt
GC Content
0.4500
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-628.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-664.27 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
443.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
This gene encodes a predicted transmembrane protein with a perinuclear Golgi-like distribution in fibroblasts. Mutations in this gene are associated with the autosomal recessive disorder congenital disorder of glycosylation, type IIk. Knockdown of this gene's expression causes decreased sialylation in HEK cells and suggests this gene plays a role in terminal Golgi glycosylation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
