Basic Information
Symbol
TMEM222
RNA Class
mRNA
Alias
transmembrane protein 222
DKFZP564D0478
chromosome 1 open reading frame 160
C1orf160
NEDMOSBA
Transmembrane protein 222
Location (GRCh38)
1:27322139-27336401
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_032125.3
Sequence length
1596 nt
GC Content
0.6159
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-681.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-706.04 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
396.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.((.(((.(((((((.(((.((((...))))..((((.((((.....(((((((..((((((((((((.((((..(((((......)))))..)))).))))..).))))))).))).))))...(((((........(((((((.(.(((((......))))).)..)))))))))))))))).))))((((((((((.((((((.((((((.....((((.......))))))))))....)))))).))))))...)))).((((((......))))))))).))))).....(((((....)))))(((.((((((.((....(((((((..............(.((((((((.((((((((.(((((((((((((.(.((...((((((((((((((..(((((....))).....))..))..))))))......)))))).....((((((......))))))..((((((((..((((((.(((..........(((((.........)))))..((...))........((((.....)))).))).))))))..))))))))....((((((((.((((((((..............))))...............)))).))))))))......((((.(((((((((((.(((((...........))))))))))....)))))).))))((((((((....(((......))).......))))))))))).))))))))))))).))))))))..))).)))))))))))))((((((((.......((((((((((.((.((((((((((((((.(((((((.((....(((((((((((((((.((((((((((((.(.(((((((...((((((((((((...(....)...)))))....))))))).))))..)))..((....))........((((((((...)))))))))))).))).....)))))))))).))))....((((.(((((....)))))))))((((((((....))))))))....)))))))...((((((((.....((((((((....((..(((((((.(((((...((......((((........))))((((((((((.....))))))))))...)).)))))..)))))))))....)))))))))))))))).((((((((....(((........((((((((...(((.(((...(((((((((((((......))))))).....................)))))).))).))))))))))))))....))))))))...........)).)).)))).).))))))))...))))))....(((....))))).))))))))))((((((....((((.((((......)).)).)))).)))))).((((((((..((((.....)))).........))))))))))))).))).....)))))))).)))...))))).)).)))))(((((((.(.(((.(((((....))))).)))).)))))))........((((....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,..(((((.((.(((.(((({((,{(({(({{..,|}||..((((.((((.....((((.((((((((((((((((.((((..(((((......)))))..)))).))))..}.))))))),))))))))...(((((........(((((((.(.(((((......))))).)..)))))))))))))))).))))((((((((((.((((((.((((((.....((((.......))))))))))....)))))).)))}))},.)))).((((((......))))))|||,||}}}....,{{(({{{{{||,|},,,.|{|||||||...,|||||{|,||.,}}}.,}|,,|,||||||||.((((((((.(((((((((((((.(.{{{{,((((((((((({{(..{(({{...,)}),....))..)),.}))))}......)))))).,...((((((......))))))..((((((((..((((((.(((........,{(((({.........)))))..{,..,||,,,.....{{{{.....}))),))).))))))..))))))))...,((((((((.((((((((..............)))),..............}))).)))))))}.,.,}}((((.(((((((((((.(((((...........))))))))))....)))))).))))((((((((....(((......))).......))))))))}}).))))))))))))).)))))))),|))}}|||||||||||||,{{({{{(,,,,,,,((((((((((.((.((((((((((((((,{(((({({(,....((((((((((((((,{((((((((((,(.,.{{|{|||,..((((((((((((...{....}...)))))....))))))).|||}..}))}.{{....}},.......((((((((...)))))))).,}),)}}.....)))))))))).))))....((((.(((((....)))))))))((((((((....))))))))....}))))))...((({((((.....||||{{({....((..{((((((,(((({,,,{{{{{.((((((,{......}}||((((((((((.....))))))))))...)},)))))..)))}|||||...,|||||}|||}|||||}.,{{|||||....,{(.,,,{{{{(({{{{,...,|||,,{{.,,||{{{{(((((((......)))))))...,,,.},,,,,.},,},..)))))),)}..))))))}))})))),...}}}}}})),,..,.,|...,},))})))).).))))))))...)))))).,,.{{{,,,.}}}}),))))))))))((((((....((((.((((......)).)).)))).)))))),((((((((.,((((....,)))}.,,...,,.))))))))))))).}))).}}.))},)))).))).))))))).)).)))))(((((((.(.(((.(((((....))))).)))).)))))))........((((....))))..
Summary
Located in dendrite. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
