Basic Information
Symbol
TMPRSS6
RNA Class
mRNA
Alias
transmembrane serine protease 6
FLJ30744
MT2
matriptase-2
transmembrane protease, serine 6
IRIDA
transmembrane protease serine 6
membrane-bound mosaic serine proteinase matriptase-2
type II transmembrane serine protease 6
Transmembrane protease serine 6
Matriptase-2
EC 3.4.21.-
EC 3.4.21
Location (GRCh38)
22:37065005-37110890
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001374504.1
Sequence length
3265 nt
GC Content
0.6325
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1501.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1556.08 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
741.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene is a type II transmembrane serine proteinase that is found attached to the cell surface. The encoded protein may be involved in matrix remodeling processes in the liver. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
