Basic Information
Symbol
TNF
RNA Class
mRNA
Alias
tumor necrosis factor
TNFSF2
DIF
TNF-alpha
TNF superfamily, member 2
tumor necrosis factor (TNF superfamily, member 2)
IMD127
TNFA
TNLG1F
APC1 protein
TNF, macrophage-derived
TNF, monocyte-derived
TNF-a
tumor necrosis factor ligand 1F
tumor necrosis factor ligand superfamily member 2
tumor necrosis factor-alpha
tumor necrotic factor alpha
Tumor necrosis factor
Cachectin
Tumor necrosis factor ligand superfamily member 2
Location (GRCh38)
6:31575565-31578336
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000594.4
Sequence length
1678 nt
GC Content
0.5429
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-600.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-630.21 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
311.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a multifunctional proinflammatory cytokine that belongs to the tumor necrosis factor (TNF) superfamily. This cytokine is mainly secreted by macrophages. It can bind to, and thus functions through its receptors TNFRSF1A/TNFR1 and TNFRSF1B/TNFBR. This cytokine is involved in the regulation of a wide spectrum of biological processes including cell proliferation, differentiation, apoptosis, lipid metabolism, and coagulation. This cytokine has been implicated in a variety of diseases, including autoimmune diseases, insulin resistance, psoriasis, rheumatoid arthritis ankylosing spondylitis, tuberculosis, autosomal dominant polycystic kidney disease, and cancer. Mutations in this gene affect susceptibility to cerebral malaria, septic shock, and Alzheimer disease. Knockout studies in mice also suggested the neuroprotective function of this cytokine. [provided by RefSeq, Aug 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
