Basic Information

Symbol
TP53
RNA Class
mRNA
Alias
tumor protein p53 p53 LFS1 Li-Fraumeni syndrome BCC7 BMFS5 TRP53 cellular tumor antigen p53 antigen NY-CO-13 mutant tumor protein 53 phosphoprotein p53 transformation-related protein 53 tumor protein 53 tumor supressor p53 P53 Cellular tumor antigen p53 Antigen NY-CO-13 Phosphoprotein p53 Tumor suppressor p53
Location (GRCh38)
17:7661779-7687546 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000546.6
BLAST PRIMER
NM_001126112.3
BLAST PRIMER
NM_001126113.3
BLAST PRIMER
NM_001126114.3
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001126116.2
BLAST PRIMER
NM_001126117.2
BLAST PRIMER
NM_001126118.2
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001276696.3
BLAST PRIMER
NM_001276697.3
BLAST PRIMER
NM_001276698.3
BLAST PRIMER
NM_001276699.3
BLAST PRIMER
NM_001276760.3
BLAST PRIMER
NM_001276761.3
BLAST PRIMER
NM_001407262.1
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001407268.1
BLAST PRIMER
NM_001407269.1
BLAST PRIMER
NM_001407270.1
BLAST PRIMER
NM_001407271.1
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000546.6
Sequence length
2512 nt
GC Content
0.5338

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-892.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -934.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 418.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a tumor suppressor protein containing transcriptional activation, DNA binding, and oligomerization domains. The encoded protein responds to diverse cellular stresses to regulate expression of target genes, thereby inducing cell cycle arrest, apoptosis, senescence, DNA repair, or changes in metabolism. Mutations in this gene are associated with a variety of human cancers, including hereditary cancers such as Li-Fraumeni syndrome. Alternative splicing of this gene and the use of alternate promoters result in multiple transcript variants and isoforms. Additional isoforms have also been shown to result from the use of alternate translation initiation codons from identical transcript variants (PMIDs: 12032546, 20937277). [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image