Basic Information

Symbol
TPT1
RNA Class
mRNA
Alias
tumor protein, translationally-controlled 1 TCTP fortilin HRF p02 p23 translationally-controlled tumor protein histamine-releasing factor Translationally-controlled tumor protein Fortilin Histamine-releasing factor
Location (GRCh38)
13:45333471-45341284 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001286272.2
BLAST PRIMER
NM_001286273.2
BLAST PRIMER
NM_003295.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_003295.4
Sequence length
4548 nt
GC Content
0.4369

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1486 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1561.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1018.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

This gene encodes a protein that is a regulator of cellular growth and proliferation. Its mRNA is highly structured and contains an oligopyrimidine tract (5'-TOP) in its 5' untranslated region that functions to repress its translation under quiescent conditions. The encoded protein is involved in a variety of cellular pathways, including apoptosis, protein synthesis and cell division. It binds to and stabilizes microtubules, and removal of this protein through phosphorylation is required for progression through mitotic and meiotic cell divisions. This gene is known to play a role in carcinogenesis, and is upregulated in some cancer cells. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image