Basic Information

Symbol
TRIM60
RNA Class
mRNA
Alias
tripartite motif containing 60 FLJ35882 ring finger protein 129 tripartite motif-containing 60 RNF129 RNF33 tripartite motif-containing protein 60 ring finger protein 33 Tripartite motif-containing protein 60 RING finger protein 129 RING finger protein 33
Location (GRCh38)
4:165016458-165041749 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001258025.2
BLAST PRIMER
NM_152620.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_152620.3
Sequence length
1847 nt
GC Content
0.4061

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-492.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -528.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 482.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

The protein encoded by this gene contains a RING finger domain, a motif present in a variety of functionally distinct proteins and known to be involved in protein-protein and protein-DNA interactions. Pseudogenes of this gene are located on more than six chromosomes including chromosome 4. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image