Basic Information
Symbol
TRMT2B
RNA Class
mRNA
Alias
tRNA methyltransferase 2 homolog B
FLJ12687
chromosome X open reading frame 34
tRNA methyltransferase 2 homolog B (S. cerevisiae)
CXorf34
dJ341D10.3
tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog B
TRM2 homolog
TRM2 homolog B
TRM2 tRNA methyltransferase 2 homolog B
rRNA (uracil-5-)-methyltransferase TRMT2B
tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog
tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog
EC 2.1.1.35
EC 2.1.1.-
Location (GRCh38)
X:101009346-101052135
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_024917.6
Sequence length
3547 nt
GC Content
0.4999
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1351.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1412.72 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
800.7
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a homolog of the TRM2 gene in S. cerevisiae. The yeast gene encodes a tRNA methyltransferase that plays a role in tRNA maturation. The yeast protein also has endo-exonuclease activity and may be involved in DNA double strand break repair. Alternative splicing results in multiple transcripts encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
