Basic Information
Symbol
TSN
RNA Class
mRNA
Alias
translin
TRSLN
BCLF-1
REHF-1
recombination hotspot associated factor
C3PO
RCHF1
TBRBP
component 3 of promoter of RISC
recombination hotspot-binding protein
testis brain-RNA binding protein
Translin
Component 3 of promoter of RISC
EC 3.1.-.-
Location (GRCh38)
2:121737103-121767853
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004622.3
Sequence length
3302 nt
GC Content
0.4070
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-926.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-992.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1157.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a DNA-binding protein which specifically recognizes conserved target sequences at the breakpoint junction of chromosomal translocations. Translin polypeptides form a multimeric structure that is responsible for its DNA-binding activity. Recombination-associated motifs and translin-binding sites are present at recombination hotspots and may serve as indicators of breakpoints in genes which are fused by translocations. These binding activities may play a crucial role in chromosomal translocation in lymphoid neoplasms. This protein encoded by this gene, when complexed with translin-associated protein X, also forms a Mg ion-dependent endoribonuclease that promotes RNA-induced silencing complex (RISC) activation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
