Basic Information

Symbol
TTC3
RNA Class
mRNA
Alias
tetratricopeptide repeat domain 3 TPRD TPRDI DCRR1 TPRDII TPRDIII RNF105 E3 ubiquitin-protein ligase TTC3 RING finger protein 105 RING-type E3 ubiquitin transferase TTC3 TPR repeat protein 3 TPR repeat protein D tetratricopeptide repeat protein 3 Protein DCRR1 Tetratricopeptide repeat protein 3 EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
21:37073226-37203112 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001001894.3
BLAST PRIMER
NM_001320703.2
BLAST PRIMER
NM_001320704.2
BLAST PRIMER
NM_001330681.2
BLAST PRIMER
NM_001330682.2
BLAST PRIMER
NM_001330683.2
BLAST PRIMER
NM_001353936.2
BLAST PRIMER
NM_001353937.2
BLAST PRIMER
NM_001353938.2
BLAST PRIMER
NM_003316.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001330683.2
Sequence length
7842 nt
GC Content
0.4167

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2162.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2311.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2507.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary

Enables ubiquitin-protein transferase activity. Involved in protein K48-linked ubiquitination and ubiquitin-dependent protein catabolic process. Located in cytosol; nucleolus; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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