Basic Information
Symbol
TUG1
RNA Class
mRNA
Alias
taurine up-regulated 1
FLJ20618
NCRNA00080
LINC00080
non-protein coding RNA 80
long intergenic non-protein coding RNA 80
taurine upregulated 1 (non-protein coding)
taurine up-regulated 1 (non-protein coding)
TI-227H
taurine upregulated gene 1
TUG1
NONHSAG033691.2
HSALNG0134930
Taurine up-regulated 1 protein
Location (GRCh38)
22:30969245-30979395
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001396518.1
Sequence length
7474 nt
GC Content
0.4312
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2141.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2283.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1938.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
Predicted to enable cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to act upstream of or within several processes, including mitochondrion organization; photoreceptor cell development; and spermatogenesis. Predicted to be located in mitochondrial membrane and nuclear membrane. Predicted to be active in nucleus. Biomarker of Huntington's disease. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
