Basic Information

Symbol
TUG1
RNA Class
mRNA
Alias
taurine up-regulated 1 FLJ20618 NCRNA00080 LINC00080 non-protein coding RNA 80 long intergenic non-protein coding RNA 80 taurine upregulated 1 (non-protein coding) taurine up-regulated 1 (non-protein coding) TI-227H taurine upregulated gene 1 TUG1 NONHSAG033691.2 HSALNG0134930 Taurine up-regulated 1 protein

Secondary Structure

MANE Select
NM_001396518.1
Sequence length
7474 nt
GC Content
0.4312

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2141.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2283.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1938.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

Predicted to enable cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to act upstream of or within several processes, including mitochondrion organization; photoreceptor cell development; and spermatogenesis. Predicted to be located in mitochondrial membrane and nuclear membrane. Predicted to be active in nucleus. Biomarker of Huntington's disease. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
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