Basic Information
Symbol
UBE2K
RNA Class
mRNA
Alias
ubiquitin conjugating enzyme E2 K
HYPG
UBC1
huntingtin interacting protein 2
ubiquitin-conjugating enzyme E2K (UBC1 homolog, yeast)
ubiquitin-conjugating enzyme E2K
E2-25K
HIP2
LIG
ubiquitin-conjugating enzyme E2 K
E2 ubiquitin-conjugating enzyme K
E2(25K)
HIP-2
huntingtin-interacting protein 2
ubiquitin carrier protein
ubiquitin conjugating enzyme E2K
ubiquitin-conjugating enzyme E2(25K)
ubiquitin-conjugating enzyme E2-25 KDA
ubiquitin-protein ligase
Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K
Huntingtin-interacting protein 2
Ubiquitin carrier protein
Ubiquitin-conjugating enzyme E2-25 kDa
Ubiquitin-conjugating enzyme E2(25K)
Ubiquitin-conjugating enzyme E2-25K
Ubiquitin-protein ligase
EC 2.3.2.23
EC 6.3.2.19
Location (GRCh38)
4:39698109-39782792
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_005339.5
Sequence length
5153 nt
GC Content
0.3611
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1328.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1432.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1483.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The protein encoded by this gene belongs to the ubiquitin-conjugating enzyme family. This protein interacts with RING finger proteins, and it can ubiquitinate huntingtin, the gene product for Huntington's disease. Known functions for this protein include a role in aggregate formation of expanded polyglutamine proteins and the suppression of apoptosis in polyglutamine diseases, a role in the dislocation of newly synthesized MHC class I heavy chains from the endoplasmic reticulum, and involvement in foam cell formation. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
