Basic Information

Symbol
UBE2K
RNA Class
mRNA
Alias
ubiquitin conjugating enzyme E2 K HYPG UBC1 huntingtin interacting protein 2 ubiquitin-conjugating enzyme E2K (UBC1 homolog, yeast) ubiquitin-conjugating enzyme E2K E2-25K HIP2 LIG ubiquitin-conjugating enzyme E2 K E2 ubiquitin-conjugating enzyme K E2(25K) HIP-2 huntingtin-interacting protein 2 ubiquitin carrier protein ubiquitin conjugating enzyme E2K ubiquitin-conjugating enzyme E2(25K) ubiquitin-conjugating enzyme E2-25 KDA ubiquitin-protein ligase Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K Huntingtin-interacting protein 2 Ubiquitin carrier protein Ubiquitin-conjugating enzyme E2-25 kDa Ubiquitin-conjugating enzyme E2(25K) Ubiquitin-conjugating enzyme E2-25K Ubiquitin-protein ligase EC 2.3.2.23 EC 6.3.2.19

Secondary Structure

MANE Select
NM_005339.5
Sequence length
5153 nt
GC Content
0.3611

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1328.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1432.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1483.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

The protein encoded by this gene belongs to the ubiquitin-conjugating enzyme family. This protein interacts with RING finger proteins, and it can ubiquitinate huntingtin, the gene product for Huntington's disease. Known functions for this protein include a role in aggregate formation of expanded polyglutamine proteins and the suppression of apoptosis in polyglutamine diseases, a role in the dislocation of newly synthesized MHC class I heavy chains from the endoplasmic reticulum, and involvement in foam cell formation. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image