Basic Information
Symbol
UHRF2
RNA Class
mRNA
Alias
ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2
RNF107
NIRF
URF2
MGC33463
TDRD23
Np95-like ring finger protein
ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 2, E3 ubiquitin protein ligase
E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2
RING finger protein 107
RING-type E3 ubiquitin transferase UHRF2
np95/ICBP90-like RING finger protein
nuclear protein 97
nuclear zinc finger protein NP97
ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing protein 2
ubiquitin-like, containing PHD and RING finger domains, 2
ubiquitin-like-containing PHD and RING finger domains protein 2
Np95/ICBP90-like RING finger protein
Np95-like RING finger protein
Nuclear protein 97
Nuclear zinc finger protein Np97
Ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing protein 2
Ubiquitin-like-containing PHD and RING finger domains protein 2
EC 2.3.2.27
EC 6.3.2
Location (GRCh38)
9:6413151-6507056
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_152896.3
Sequence length
3576 nt
GC Content
0.4407
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1094.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1162.03 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1017.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
This gene encodes a nuclear protein which is involved in cell-cycle regulation. The encoded protein is a ubiquitin-ligase capable of ubiquinating PCNP (PEST-containing nuclear protein), and together they may play a role in tumorigenesis. The encoded protein contains an NIRF_N domain, a PHD finger, a set- and ring-associated (SRA) domain, and a RING finger domain and several of these domains have been shown to be essential for the regulation of cell proliferation. This protein may also have a role in intranuclear degradation of polyglutamine aggregates. Alternative splicing results in multiple transcript variants some of which are non-protein coding. [provided by RefSeq, Feb 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
