Basic Information
Symbol
UMOD
RNA Class
mRNA
Alias
uromodulin
Tamm-Horsfall glycoprotein
uromucoid
uromodulin (uromucoid, Tamm-Horsfall glycoprotein)
ADMCKD2
ADTKD1
FJHN
HNFJ
HNFJ1
MCKD2
THGP
THP
Tamm-Horsfall urinary glycoprotein
Uromodulin
Location (GRCh38)
16:20331549-20356402
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003361.4
Sequence length
2315 nt
GC Content
0.5819
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-904.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-944.33 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
911.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...................((((((((((((((.....((((((...((((((..........(((....))).))))))))))))((((((.((((...((...(((((((((((((((((....((((.(((((((......)))..(((((.((((.((((.(((((((((....)).))))))).))))))))...(((((..(((((.(((......)))))))).))))).(((...((((.((((((((.(((((..((((......(((.((((((.((((((((.....((((((..(((((.(((((.(((((((((((((.((((((((((..((((((........))))))......(((((.((((....))))((((........)))).((..(((((((((((....)))).)))((((..(((((((((......((((...((((.(((((((....))))))))))).))))((((..(((((((......)))))))))))........((((.....((((.(((....))).)))).......)))).((.(((((((.(((((....((((((((..(((((((((((((((.((((.((...)).)))).)))))))).)))).)))..).)).))))).)))))..))))))).)))))))..))))..))))..)))).))((((((((..((((((.((...)).))).)))..))))))))((((((.(.(((((((.((......)))))))))).)))))).))))).....((((((......)))))).))))))..)))).)))))))..((((.....))))..(((....)))..((((.(((.(((((((...))))).)).))).).)))))))).))))))..)))))..)))))).(((......))).....(((.(((.((((((((((((.....(((((.....)).)))......))))...)).)))).))))).)))..((((((..........))))))..........((((((......))))))((....)).(((..(((.......)))..)))))))))))((((((.((((((..((((((((....(((((....)))))(((((.......)))))(((((........)))))....(((((((((((..(((..(((.((((.(....).)))))))....)))..))).(((((.(((((.(((......)))))))))))))(((((((...(((((...((((((..(((..(((.....)))....)))....))))))..)))))..)))...((((.((((.....)))).)))).)))).......(((((.((((.(((........)))))))))))).....)))))))))))))))).))...)))).)))))).......))).))).)))....)))).))))).)))))))).)))))))..))))).)))).))))......((((.......)))).(((.(((........))).))))))))))))...((((((((..(.((((((((((((.....))))).....(((.((((..((.......((...))......))..)))).)))...((....))((((....)))).))))))).)..).)))))))....(((((((.((.........(((((((((.....(((((.....((((((....(((((((.(((.......(((..(((((..........)))))..)))..(((((.((((((....((((((((((............((....))...((((((.(((((.....))))).)))))).))))))))))......(((((((((......))).......)))))).((((((.((((((..(((((....((((((((((.((((...)))).))))))))))))))).....)))).....)).))))))......)))))).))))).)))...))))))))))))).))))).(((((..((((...((((((((...))))))))...))))..)))))...))))).))))(((((((((.((....(((......)))..)).))))))))).............((((((......)))))))).)))))))...))))))))...))...)))).))))))...))))).))))))))).(((((((......))).)))).........((((....))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.................((((((((((((((.{.({({{({{.(((((((({,...,,...(((....}}},||||}}}}}}},{(((((.((,,...||}}}|{{{{{{{{|{{{(((({{..{(({{(({{{{{||{||||||.{{{{|||{(((.,((({{((((((((....|}|,}}}}}),)}})}})),,,|{{||,,((((,,(((......)))))))).}}))}.{||...|{{{.{{{(((((((({({{(((({({.,(,{(.,{.{{||}|.,|||||}}}}.,|(((|..|||||..|{{,{{{||{,(((((,({{.((((((((({,(((((........)))))}....,,(((((.((((....||||{{(({{,,,,,.|,|{{{{.,(((({{{((((....)))).|}|((((,,(((((((((,{,,..((((...((((.(((((((....))))))))))).))))((((..(((((((......))))))))))).....,,|{{||,,.,,((((.(((....))),)))}.,....{||||,,,.||||||({(({({{{{.,,,))}||}}||,.(((((((((((.((((.((...)).)))).)))))))).)))|{{{|.,{{{{,||||,,||||||||||||||||||||||.|||}|,.}}}||.}|}}.,}||||||||,.||||{|}||},.}},})),)||,.}}))}}})|||||||||||||{|{,||||,,,,}}||||||||{||,,||{||,}},..,|(({{((,,...{||||||{..|||},}||,,,((((....)))).}|}}.}}}}}})})}},.}}||||}}}|||||||,|,}|||,.,}||}||||||||,||||||||}||||||,.,|||},,}}}}||,||{,.,...|{{.....,,{}|||}||||{||||,||,}},,|||||{{,{|||,|}}.|,,|,||||{,.||,||}}.}|}||,|||,,|{({({,|......},))}))}..,,......{|||||.,,,,.))})))||}|...}}|||,,,,....,}.}}}},.},,}}}))}||||||{{,((((({..{{{(((((,,..(((((....)))))(((((,{....}))))){(((({,,,,,,,|}}}|.,..{(({|{{{,{{.{(((,{({{,{{{{,{.,,})}))}}}},.,..}}}..,},.(((((.(((((.(((......)))))))))))))..|||||,}.({(((,..((((((.,({((.{((.....)}|,||.,,}...,)}}}}}.,}}}},..))}.{,((((.((({.....)))).)))}.},,,.......(((((.((((.(((........)))))))))))).,}}}))}}}}||||||}}}},||...)))}.}}|||||.......))})))))))).,}})|||||,,,.,)))))))})))))}|}|}}})).,}},.}}}..}}}}}|{{(,,....,))})}|||,|||,|,.,}}|}}}.|||},..,{|||{{.(((((((.,.({((((((((((({....,))))),..|,(((,{(||..{{......,{{..,}.......}}))}))).,})...({,,,,)){(({....}))}.))))))}.},}}.))))))).,,,|}||||,.,.....}}}.}))}}}))}},,,}}||{||},,,,{(((((....(((((((.{{{...{(((((....))))}}.,...,,,.,,))}..,,.,(((((.((((((....{(((,((((({..........,|,{{{.,....,,|||{,{(((({{.,.|||,|,,}||||{,||}},,,}}.,,.}}||||,||..}}}.,,}))}})),..}}}}}}..,||||}|||||,..,(({{{{{{((((({{{((.((({.,,|))}.}}}}}))))}))}})}}},.}}}..,..,))})}}))}}}..,,)))))).))))).}}),,.))))))))))))),||}}}.(((((..((((...((((((((...))))))))...))))..))))),,})}}||||||,(((((((((.({.,,.(((......))).,)}.)))))))))............,|||||{.,,,,.}}))))}}}}}}}}}...}))))))})}}}))....))),}}}}))}.,))))).))))))))).(((((((......))).)))).........{{{,....,}}}...
Summary
The protein encoded by this gene is the most abundant protein in mammalian urine under physiological conditions. Its excretion in urine follows proteolytic cleavage of the ectodomain of its glycosyl phosphatidylinosital-anchored counterpart that is situated on the luminal cell surface of the loop of Henle. This protein may act as a constitutive inhibitor of calcium crystallization in renal fluids. Excretion of this protein in urine may provide defense against urinary tract infections caused by uropathogenic bacteria. Defects in this gene are associated with the renal disorders medullary cystic kidney disease-2 (MCKD2), glomerulocystic kidney disease with hyperuricemia and isosthenuria (GCKDHI), and familial juvenile hyperuricemic nephropathy (FJHN). Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
