Basic Information

Secondary Structure

MANE Select
NM_001003940.2
Sequence length
4692 nt
GC Content
0.5473

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1821.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1900.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1467.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001398502.1 AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4797 nt 0.5464
NM_001398503.1 AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4667 nt 0.5382
NM_001398504.1 AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4719 nt 0.5382
NM_001398505.1 AGUUGUACCAGUCUCAGGUUCAGAGCUGGCAGGAGCGGGAGGCUGUGGA… 4533 nt 0.5389
NM_001398506.1 GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4664 nt 0.5371
NM_001398507.1 GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4530 nt 0.5377
NM_001398508.1 AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4502 nt 0.5462
NM_001398509.1 AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4612 nt 0.5453
NM_001398510.1 AUUUUGGAAACAAUACCGCACCGUGCGGAGUGGCCUCCUCCCGCCCCGG… 4403 nt 0.5428
NM_033503.4 GGCUUUUGUUUUUGCUGCUGAGCCUGGAGCUCAGCUCAGACUGAGAUAA… 4728 nt 0.5349
Showing 11 to 20 of 20 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the BCL2 protein family. BCL2 family members form hetero- or homodimers and act as anti- or pro-apoptotic regulators that are involved in a wide variety of cellular activities. This protein contains a single BCL2 homology domain 3 (BH3), and has been shown to bind BCL2 proteins and function as an apoptotic activator. This protein is found to be sequestered to myosin V motors by its association with dynein light chain 2, which may be important for sensing intracellular damage and triggering apoptosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image