Basic Information

Symbol
USP36
RNA Class
mRNA
Alias
ubiquitin specific peptidase 36 KIAA1453 FLJ12851 ubiquitin specific protease 36 DUB1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36 deubiquitinating enzyme 36 ubiquitin thioesterase 36 ubiquitin-specific-processing protease 36 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36 Deubiquitinating enzyme 36 Ubiquitin thioesterase 36 Ubiquitin-specific-processing protease 36 EC 2.3.2.- EC 3.4.19.12 EC 3.1.2.15

Secondary Structure

MANE Select
NM_001385174.1
Sequence length
5872 nt
GC Content
0.5588

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2190.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2291.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1336.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.(((((((((((((((...(.((((.....)))).)...))))))))))(((((.((((((.(((((((((((((((((((...(((.(((((..((......))))))).)))....)).))).......))).)))))))).((((...)))).............))))))))).((((((.((((..((((..((((..(((((.((((((....(((((((((.((((.(.(((.((((((((((.((((....((((((((.((((.........))))(((.((...(((((((((((((....(((((((..(((((((.(......).))))))).))))....)))......((((((..((......))..))))))((((........))))((((...)).))..((((((((.(((((..(((........))).(((.(((.((....(.((((.......))))).....)).)))..)))..)))))))))))))..((((...(((((((((((((..(((((((.(((..(((((..((((.((((((....).))))).)).)))))))....))).))).))))...)))))))(((.(((((((.(((.((((((((((((.((.((......))))))))................(((.........))).((((..(((((((((((((((((((.((((((.((.(((((((((.(((((((..((((((((...........(((.((.(((......))))).))).(((.((.((((((((...(((.(((.(.(((................))).).))).)))...)))).)))).)).)))))).)))))..)))).....))).)))))))))(((((((.....((((.(..(((...)))..)))))...))))))).)).))))))((((.........)))).((.(((((....((.((((((.(((.((((.((((....))).).)))))))........((.....))...)))))))))))))))))).)))))))).......))))))))))))((.....)))))))))).))).(((.(((((((((.......((((.(((((...((((.......(((....))).....((.(((((.(.(((.((((.........(((((................((((((.(((...((((.((((((((((((.(((..(((((.(((...((((..........((((.((((((((((((((((......))).))......)))))))))))..))))(((((((((.((.((((((((...((((((.(..((((((.......)))).))..).))).)))(((((((...((...((......))...))...))))))).(((((.(((..((((....(((...)))...))))))))))))((((....((.........))....)))).)).)))))).)).......)))))))))...............))))..))).(((((...........)))))........))))).....)))))))..)))).)))).)))).)))))))))..)))))))))))).).)))))..)).((((((((((....))..))))))))((.......))...(((((..((((..((((....(((((((.(.(((((((((.......((((.....((((........))))......((((((..................(((.((((((......))))...)).)))........((((((((....((((.((((.....)))).)))).)))))))).)))))).)))).....)))).))))).).))))))).....)))))))).((((((((..(((((((((..(((((((.............((((((((...(((((..((((....))))..)))))..((((..(...(((.(((((((((((.....))((((((.....)))))).((.....))....))))))).))..)))......)..)))).......)))))))))))).))).)))))))))...))))))))...((((((((((((.((.(((...........)))))...))))))))).)))......((((..(((.(.(........).).)))..))))......))))))))))))))))))))).)))))))))........((((((..((((....))))))))))....(((((((((((.(..(((((((((....(((.......................))).............(((.......)))....)))))))))......).)))).))))))).))))))).))))))))).)))).)).))))).)))))))))))......)))))))).......))))))))....(((((.(((((((((((((((((((((((((.....((((...))))....))).)))).(((((((((.((.((((..((....((((.......)))))).)))))).)))).)))))........(((((...)))))(((((.((((..((((...((((((.(((((((((.(((.(.((........)).)(((((...........)))))))).)))))))))))))))(((.(((((((.(((.((.((((.((((..((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((..(((.(((((..((((((.(((....(((((((((((((((((((((((.((.(((((...))))).))..(((((..(((((..((((((((..((((((((((((((..((((...((....))...))))..((.(.(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((.((........)).)))))))))).............))))))).((((((.(..(((....)))..).))))))....((((((..............................))))))...((((((............(((((((.....))))))).((((.(((..(((((((((((((((.((((((.((..((.(((((.(((.......)))...))))).))..)))))))).))).((((((......))))))....)))))))))......((((((...((((........))))..))))))....((((.((((((..(((((((.(((((...(((((((.((((...((((...))))(((((((.((..(((((((..........((((.((((((((.((.((((.((((((((..((((((((((..((((((((.....((((((......(((((....)))))........((((........))))....)))))).......))))))))..))....))))))))..)))).))).((((....))))....((((((..(((...((((((...((.((((.((((((.((((..((....))))))...)))))))))).)).))))))...)))))))))..).)))).)).))))).)))))))((((((((((((......))))....))))))))...))))))))).)))))))......(((((((....))))))))))).))))))).))))).))))....(((((((((....(((.(((((...(((((.((.......(((((((((.(((((....))).)).))))))))))).)))))...))))).)))..(((((((....)))))))..(((((......))))).)))))))))))))))))).))))((((((..(((....))).)))))).))))))))))(((.((((((((((((((((((((.((((........))))))))))))...)))))..)))))))))).))))))))))).)))))))))).))((....)))))))))))))))))))))))).(((((((((((((.((((..........((((((((((((......)).....)))).)))))).........)))).))))))).((((.....))))((.(((((((((((((((.(.((((((((((..((((...))))...)))).))))))).)))))))))))))..)).))....))))))..(((((...(((((((........)))))))....((((.((((((((((....))))))))))))))(((((((.........))))))).........(((((.......)))))..))))))))))....)))))((((((((...........((((...((((((((.....)))))))).....))))(((((....((.((((.....)))).))..)))))((((((....))))))))))))))..)))))))))))....((((((..........))))))...((((..(((((.......)))))))))...........))))))......(((((((((((...((...))....)))..))))).)))((((......))))((((((((.((.(((....)).).)).)))))))).((((.....))))........))))))...))).)))))).(((((.((((((...))).))).)))))..))))).)))..))))))).........(((((((.(((((((((((.((((.....((((.(((((.(((((((((((.((.((.((((.(((..(((((.....(((((((((((..........)))))))))))....)))))..))).))))(((((((((((......((.(((((......))))).)))))))))))))..)).)).))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))....)))))))))))..(((...)))...((((((((.(.(((((.(((...))).))))).)))))).)))....(((((((((((.(.((((((((((....).))))))))).).)))))))).))))))))))....)))...)))))).........)))))).((((.....)))).((((((((((..........((((((.....)))))))))))))..))).)))).)))).))))))))).))).)))......)))).))))))))).......................)))))))))(((((((...(((..(((((..(((((((((((((.(((((......))).).).)))))))))))))....))))).)))((((((((((........(((........)))))))))))))...((((((((.(((..............))).))))))))....)))))))..((((..(((((((((((.((((..((((.(.(((....))).)))))..))).).))))).))))))..)))).)))))))...)).)))))((((.(((((((((((.....))))..........(((((......)))))...))))))).))))....))))))..))))))).).))))))))))))))))))))......)))).(((((.....)))))..((((....))))))))..)))).)))))))))))...........)))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,((((.(({({((((((((((...(.((((.....)))).)...)))))))))){|({{.((((((.(((((((((((((((((((,..(((.(((({.,((......}}})))).)))..,.)).))).......)))))))))))).((((...)))).............))))))))),((((((.((((..((((..((((..(((({{((((((....(((((((((.((((.(.(((.((((((.....((((....(((..(((....)))..)))....))))((((.((((((((.,,..(((({.{{(((((,.(((((((.(......).))))))).)))),...}}}......,(((((..((......))..))))))))))...)))))}})).))))...((((((.......))))))...(((........))).,...(((.((((....)))).)))..,,,...{(((((((..(.((((((.(((((({.(((((((({(({.(((...(((((((..(((((((.(((,{,{(({((((((.((((((....).))))).}).))))).)},,}))).))).))))...)))))))...)))..||}.(((.((((((((,(((.{..,,..,,,,||||,,||................{{,........{|||,({{..||(((((((((((((((((({((((((.((.(((((((((.(((((((,.((((((((.....,,,...(((.,,.|||....,,|}},,.))}.{((.((.((((((((...(((.(((.{.(({...{.{{....}}...})).).))).)))...))))))))).)).))}))),})))),.)))).....))).)))))))))(((((((.....((((.(..(({...}))..}))))...))))))).)).))))))|(((.........))),,((.(((((....((.((((({.(((.((((.((((....))).).)))))))...{{.,.({.....)).}))))))))))))))))))),}))))))).......)))))))))))).....}}).)))))))).))),}.(((.((((((((.{{{{.{.,...(((.....)))...,|,||||,,..(((((((.(((((.{(.((.(.((((((((((,.(((...................(({....))..,,....((((((((((.{((((({,((((((((((,,(((((({......(((((((((((((((((((((((......))).))......))))))))))).....((((((((((.....}))))..)))))((((......))))......(((((.((((((((((.((..,((((,((((.(((({..,,....,}).,))))))))).((((,,(((..{((({{{,,,{,},}},},.)}}})))))))){{{{...,({........||}....,}},..)}}}.((((((((..(({...))).)))).)))).((((((((.((((((..((((.((((((((((..,.((((((((({...,((({{.{((({........,,))}}.)).}}}|,..,,........((((((((......,..,..(((((((({(....}}..)))))))).,....,{(((..,(,...|,.}}))))}}}...))))))))..(((.((.,,........)).)))...((((.......,)))}..........{(((((((((.{(((((((((((({(({((..,.{{{{(({.((..((({.,{,,||,.{||..}.,,,|||........((((((.((((({{{{,({((..,{....)))),.)),.....}.))))).)))))){{{...((((((,.{.((((((((((((((.((((((((((((((((((.......((((({(((....}}},.,||},..(((,..((((((((((((.......((.((((((({{{....,||.((((....(((((..{((((((.(.{{..,.(((((((.,.,,,{{{.....(({{,.{{{..{{....)).,))),),}}}}..,,.,||.|,..,.},|||,.,,..,}))))).,.))))))).,,,....(((..((((((((((((((.(((...{..((((..(((.(.(......,.).).)))..))))..}...))).)))).........(((((((((({,((........((((((..((((....))))))))))....)))))))))).))).(((((((((....({{.......................)}}.............||{.......,,,....))))))))))))))))))).))).....),))}.)))))).)....)))))))))......))))}}))))......))))))))))))...,|||.....(((((((.((..((((...((..(((((.(((.........(((((((.((((((........((((((.((((.{,.,...}}}).}|{(.{.{(((((((...,{,.{.{((...))}.}.}}.,|{,,,.{{{{{..,|||}}...|||||.......}}}}|(((((.(((((((((.{{({{,{{.|......},{|(((((...........)))))))).)))))))))))))))))..,.)))))))).}.}})....)))))).))))))..))))).)}.))))))))..)).))))...}},..).)))))).,|(({{,({({{..,,.,(((((,,(({{((((((((((.{(.(((((...))))).))..{{{(({....{|||((((((((..((((((((((((({.,((((...((....))...}))),.{{.(.(((((((((.(((((...((,(({(..((((((((((.((........)).))))))))))..,,{{(({{{,{{|{((({.((((((.(..(((....)))..).)))))).,},|{((({............................,.}|}|||.,,({((((,,,.........(((((((.....))))))).{{.,||||.,||{((.{((,((,{({({(((,(((.(((.((((((,(((((..{{||....|||,|||,{{{|||||{((((|{((((((......))))))((({{{.{{{{......))}}))))}}.,,,,}}}}}}}})))),}))))))....{(((.(((((({.,{,((((.(((((...(((((((.((((...((({...})))(((((((.((..(((((((........||((((.{{{(((((.((.((((..(((((({..((((((((((..((((((((.....((((((......{{{((....,})))........{{{(.,......))))....)))))).......))))))))..))....))))))))..)))).))).{(((....))))....((((((..{((...((((((...((.((((.((((((,((((..((....)))))).,.)))))))))).)).))))))...))})))))),.}.)))).)).)))))|))))))}(((((((({{{{.,.,..,})).,,.))))))))...))))))))).)))))))......(((((((....))))))))))).))))))).))))).))))....{{{{{{(((,,..(((.(((({...(((((.{(,{{{{,.(((({{({(.{||||},,.)))})}.}}))))))))),))))),..})))).|||..(((((((....)))))))..|||||,}},.,}}|||,|}}}}})))))))))))).)))}(((((((,{((....)))}))))))..}))),,,}},))})).}))))).)))))).|||}||,,........))}))),)))}}}..,))).}}))))))})))})))),,))))).)))))))))}.))((....))})))))))))))))))))))}|.(((((((((((((.((((.,........((((((((((((......)).....)))))))))))......}.,)))).))))))).{(((.....)})|,{.(,(((((((((((((.{.((((((((((..((((...))))...}))).))))))}.)))))))))))))..)}.}}....)))))),,(((((.{,((((({{.....,},)))})))....((((.((((((((((....))))))))))))))(((((((.........))))))).........((({,.......,}})).,})))),}})))}},))}},((((((((,..........{{{{...((((((((.....)))))))).....}}}}(((((....((.((((.....)))).))..))))}((((({....))))))))))))))..)))))))))))))..((((((..........))))))...((((..(((((.......)))))))))...........,)))))...,,,)}))|,.({(.((((({(........)).))))),.)}}((((......))))...,,,,))))})))))....,.))))))))).))))))))){,({..{{{......,,}}},.},.},(({(((,...}})}))}}},,.,)))))))))))))).),)))))).)))}))},},||{,|,..,,..||||{({,...,,...}}}}}}}.,.....))))}}))))))))...)))))))).,.,{{{{......}}}},(((((((((((..........))))))))))),.)))))))))))))))))))......)))){((((((.(((((......))))).))))))}.)))))).))))..))))))..(((.((((.....((((.(((.((.((,{{,...))})))).))))))))))))))....,{{..{{|||{((,(,(((((,{((,..}}}.))))},)))}}}.,}),,,}},))))))))..))...))))))))))))))).))))))).......))).)})),,}..).)))))))))})).))))..}.))))))))))...)}}...))),.)))))))))).).))....,)..))},)).)))))))...||}},,.}}}.}}....)))))))),}}|{{,((((...(((..(((((((((({{{(((..((.((((((((..(((((.....)))))...))))...)))).))..)))((((((((((((.(,(((......))).,.).)))))))))))){.(((((((.............))))))).}.,,........,)),))))))))))..)))))))...}}}....((((....))))}}),)))))))),,...,,,..||{{{..(((((((((((.{(((..((((.(.(({....})).)))))..))).}.))))).))))))..}}))))))|((((..(((.((((.(((((.(.{(,{(((.....)))))}.)))))))))).))))))),...,,)))))).)..))))))))))))))..))))))).).))))))))))))))))))))...,,,)))).(((((.....)))))..{(((....))))))))..)))).)))))))))))...........}}})),,)))}.
Summary

This gene encodes a member of the peptidase C19 or ubiquitin-specific protease family of cysteine proteases. Members of this family remove ubiquitin molecules from polyubiquitinated proteins. The encoded protein may deubiquitinate and stabilize the transcription factor c-Myc, also known as MYC, an important oncoprotein known to be upregulated in most human cancers. The encoded protease may also regulate the activation of autophagy. This gene exhibits elevated expression in some breast and lung cancers. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image