Basic Information
Symbol
VEGFA
RNA Class
mRNA
Alias
vascular endothelial growth factor A
VEGF-A
VPF
vascular endothelial growth factor
L-VEGF
MVCD1
VEGF
vascular endothelial growth factor A, long form
vascular endothelial growth factor A121
vascular endothelial growth factor A165
vascular permeability factor
Vascular endothelial growth factor A, long form
Vascular permeability factor
Location (GRCh38)
6:43770184-43786487
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_003376.6
Sequence length
3609 nt
GC Content
0.5126
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1317.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1384.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
799.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
This gene is a member of the PDGF/VEGF growth factor family. It encodes a heparin-binding protein, which exists as a disulfide-linked homodimer. This growth factor induces proliferation and migration of vascular endothelial cells, and is essential for both physiological and pathological angiogenesis. Disruption of this gene in mice resulted in abnormal embryonic blood vessel formation. This gene is upregulated in many known tumors and its expression is correlated with tumor stage and progression. Elevated levels of this protein are found in patients with POEMS syndrome, also known as Crow-Fukase syndrome. Allelic variants of this gene have been associated with microvascular complications of diabetes 1 (MVCD1) and atherosclerosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. There is also evidence for alternative translation initiation from upstream non-AUG (CUG) codons resulting in additional isoforms. A recent study showed that a C-terminally extended isoform is produced by use of an alternative in-frame translation termination codon via a stop codon readthrough mechanism, and that this isoform is antiangiogenic. Expression of some isoforms derived from the AUG start codon is regulated by a small upstream open reading frame, which is located within an internal ribosome entry site. The levels of VEGF are increased during infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), thus promoting inflammation by facilitating recruitment of inflammatory cells, and by increasing the level of angiopoietin II (Ang II), one of two products of the SARS-CoV-2 binding target, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2). In turn, Ang II facilitates the elevation of VEGF, thus forming a vicious cycle in the release of inflammatory cytokines. [provided by RefSeq, Jun 2020]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
