Basic Information
Symbol
VMP1
RNA Class
mRNA
Alias
vacuole membrane protein 1
EPG3
TANGO5
ectopic P-granules autophagy protein 3 homolog (C. elegans)
transport and golgi organization 5 homolog (Drosophila)
transmembrane protein 49
TMEM49
ectopic P-granules autophagy protein 3 homolog
transport and golgi organization 5 homolog
TDC1
Vacuole membrane protein 1
Transmembrane protein 49
Location (GRCh38)
17:59707192-59842255
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_030938.5
Sequence length
3686 nt
GC Content
0.4004
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1037 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1107.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
805.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes a transmembrane protein that plays a key regulatory role in the process of autophagy. The ectopic overexpression of the encoded protein in cultured cells triggers autophagy even under nutrient-rich conditions. This gene is overexpressed in pancreatitis affected acinar cells where the encoded protein mediates sequestration and degradation of potentially deleterious activated zymogen granules in a process termed, zymophagy. [provided by RefSeq, Jul 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
