Basic Information
Symbol
ZBTB16
RNA Class
mRNA
Alias
zinc finger and BTB domain containing 16
PLZF
promyelocytic leukaemia zinc finger
zinc finger protein 145 (Kruppel-like, expressed in promyelocytic leukemia)
ZNF145
zinc finger and BTB domain-containing protein 16
zinc finger protein PLZF
Zinc finger and BTB domain-containing protein 16
Promyelocytic leukemia zinc finger protein
Zinc finger protein 145
Zinc finger protein PLZF
Location (GRCh38)
11:114058335-114256765
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_006006.6
Sequence length
8494 nt
GC Content
0.5188
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3131 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3285.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2033.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
This gene is a member of the Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family and encodes a zinc finger transcription factor that contains nine Kruppel-type zinc finger domains at the carboxyl terminus. This protein is located in the nucleus, is involved in cell cycle progression, and interacts with a histone deacetylase. Specific instances of aberrant gene rearrangement at this locus have been associated with acute promyelocytic leukemia (APL). Alternate transcriptional splice variants have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
