Basic Information
Symbol
ZBTB44
RNA Class
mRNA
Alias
zinc finger and BTB domain containing 44
HSPC063
ZNF851
BTB (POZ) domain containing 15
BTBD15
zinc finger and BTB domain-containing protein 44
BTB/POZ domain-containing protein 15
zinc finger protein 851
Zinc finger and BTB domain-containing protein 44
Zinc finger protein 851
Location (GRCh38)
11:130226677-130314917
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001301098.2
Sequence length
7399 nt
GC Content
0.3926
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2011.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-2151.93 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1505.7
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.((((((((((((((........))).((((.((((...((.((..((((((((((....))))).))).))..)).)).)))).))))...(((.(((.(((((((((((..(((.(((((((.....((.((((((((((((((((...((((.((....)))))).))))..........(((((....(((..(((((.....))))).))).(((.(((((..((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((...(((((((((..................))))))))))))).)))...)))((((((...))))))....(((.(((..(((((....(((((...((((((((((((((.....(((((......)))))..((((((((.(.(.((.((((.....)))))).).))))))))))))))))))).))))...))).))......)))))))).))))).))).)))))))).).))).....)))))))).))))))))..)))))((((((.((.....(((.((((((((........((((.((((((((..((..((.(((((((....)))))))))..))..))))))))..))))(((((.....)))))..(((.......)))..((((((.....))))))(((..(((((((....((((((.(((........)))))))))....)))))))...)))(((((((((((......))))........))))))).....)))))))).))))).))))))((((((...(((((((((((....((.(((((............................))))).)).......))))).............)))))))))))).((.(((.((((((.(((((((((.(((((.((((((..((......))((((((((((.....))))))))))....((((((.(((((.(((....)))((((((...)))))).((((.....)))).((((((.......((((.((.(((((((.....))))))).))...))))))))))..((((((.((........)).))))))(((((((((((((((((((((.(((((((((....))).....(((((((((((..((((((((((........(((((...((.((((((...((((...((((.((.(((((........(((......)))............(((..(((((.(((..((((....))))..).)).)))))...))))))))..))..))))....)))))))))).))...((((((...(((.......(((((.((.(((((.(((.(((((....((((.(((....)))))))....((((.((((((...((((.(......).)).))))).))).))))........(.((((.(((((((((....((((.((((...((..((((......(((((......)))))))))..)).)))).)))).(((..........)))....))))))))).)))).)...)))))))).))))).))))))).......)))...))))))))))))))).))))))....((((....((((....))))..(((((.((((....)))).))))).(((((..(((..........)))..)))))(((((((((((((..((......((.(((((........((((......))))...((((((((((((((((.(((((.....)))))(((((..((((....((((.....))))..((((((..(((((......))))))))).))..(((.((((((....))).))).))).((((..((((((.((((((((..(((((.((((((((((.(((...((((((((.(((((((..(((((((............((((((((.......((......))))))))))((.........))..((((((......)))).)).......))))))))))))((((...((((((((.......(..((..((((.(..((........))..).)))).))..)........))))))))..))))....)).))))))))((((((.......(((((((........)))))))......(((((((((.(((((((((...))))...((((((((((.....((((((((((((.........(((........))).(((((.(((((....)))))..))))).)))))))).))))..........(((..(((.....)))..)))....)))).)))))).........................................)))))..(...(((((.(((.(((..(((((((((....))))))).))....)))..))).)))))...).......(((((........)))))..)))))))))(((((((........)))))))((((((.((((((....)))))).))))))..))))))....((((((((((((((((((((....)))))).)))......))))))))))).....(((((((((((....(((((((((((.(((.......(((...))).....))))))))))))))(((((......)))))((((((..((((((((((..((.....)).))))))...))))..))).)))....(((((((((....((((((..(((((((((((((((((....)))))))))(((((.......)))))................((((.(((((......((((.(((....)))))))(((..(((((((...........)))))))..)))...)))))))))(((((((((......(((....)))......)))))))))...)))))))).)))))))))))))))....(((.((.(((((((((.......))))))))).)).)))(((....(((((((......(((........)))......)))))))....)))..))))))).))))))).)))))))))))))))......(((.....))))))))))))))))).))))((((....))))((.((((....)))).)).........((((((((.(((((((..........((((........(((((((.((((.(((((((.((((.(((((((((((((...(((((((((((((((....((((((((((((....((((((...((((.....))))))))))))))))))))))..............(((((((((((....)))..))))))))......)))))))))))))))..((((((((........))))))))(((((.(((...((((((((((........)))))).))))...))).(((((((.((((..................)))).)))))))..)))))....(((((..((((...((.(((((((((((((((((..(((...(((((...)))))...)))......................(((((((((((.....(((((.((((((((((...(((.((((...(((((.(((((.((((((...((((((...)))))).........(((((((((...((....))...)))))))))....((((((....))))))..(((((((((............))).))))))..............((((......(((((((((..................)))))))))....))))...(((.((((.(((((..((((..((((..((((((......(((((.(((((((.....))))))).....((((...))))..(((((((((((.(((.....(((..(((((((((..(((.....)))..)))))))))..))).........(((((((.(...(((((.....(((((((...(((....))))))))))))))).).)))))))........))).)))))).))))).........)))))....))))))..))))..))))....))))))))).)))..((((((((..(((((.(((........((((((....)))))).......)))..)))))))))))))..)))))).))))).)))))...........(((((((((..((((((......))))))..)))))))))............(((......)))(((((((((.((((.((((.(((((((....)).))))).((((((.......((((((((((........((((............)))).....(((.....)))...............))))))))))))))))....)))).))))...)))))))))......((((....))))...))))..)))..)))))))))))))))....)))))))))))..(((((..........))))).................(((.((((...)))).)))..(((((((.......((((.(((..(((((...))))).))))))).....))))))).)))))))))......))))))))))..)))))))))..))))))))))........(((((((((.(((((((((...........(((((((..(((......)))...))))))).....)))))(((((((((........)))))))))....(((((((((......)))))))))....(((((......)))))...)))).)))))))))((((((((..(((...)))..))))))))...))).)))).)))))))))))((((......))))......))))))).....)))).((..(((....)))....))(((.((((((((.((......)).)))))))).)))))))).)).))))))))...((((((.(((..((((........))))..))).))))))))))..)))))((((......((((........(((((((((.....((..(((......))).))....)))))))))))))......))))))).))))).))).....))))).....)))))))))..)))))))))))))....)))))))))))))))......(((..(((......)))..)))(((((((......))))))).((.((((((........(((((....))))).......)))))).))(((((((....)))....))))(((((((((((......((((((......))))))..........((((.((((((((((.((((((((.......)).)))))))))))).)))).))))...))))))).))))(((((((((.....((((((....))))))..))))))))).))))))...)))))))))))).)).)))))))....(((((((((.((((.....(((.(.((((((...((((.((....((((((...))))))((((((..((((.((((((.((((......(((..(.((((((((((((((((...........)))))))))))))))).).)))......))))((..(((((((...........)))))))..))....(((((((........)))))))((((((..((((((((((..((..((.......((((((((((((((......((((............((((((((((((......((((((....(((((..((((((.....))))))(((......)))))))).....)))))).......))))(((((((((((((...(((........)))..))))))).))))))....................((((...)))).....((((......))))....(((.(((((((((((((((.(............((((((((((((...............)))).))))))))............).))))))))).)))))))))))))))))..(((.....)))...)).))......))))))))))))))..))..))..))))))))))..))))))((((((((...(((.((((.....(((((............))))).....)))).))).)))))...)))......(((((....))))))))))).))))..)))))).......((((((((((.........))))(((((....))))).)))))).)).))))...)))).)).).)))......)))).)))))))))))))))))))).))))..)))))))..))))))))).))))))..))).)).....)).))))))))))))....((((((..(((((((....((.....((.....))...)))))))))....)))))).......))))))).)))..)))))))...((((((......)))))).((((.((((((((.....(((((.........)))))(((((((((....(((((((((.((..........((((..(((((..(((((.(((((......((((((......)))))))))))))))).....((((((....)))))).((((........))))...)))))..))))((((((..(......)..)))))).(((((((((((((.((.(..((((((......((((((...((((((..(((((...((((((((((....))))).(((.((...(((((....)))))....)).))).....))))))))))..)))).......((((((((.((((...)))).)))))))).(((((((...)))))))................)).....))))))......))))))..).))))))))))))))))))))))))))..)))))))))......(((((.....))))))))))))).)))).((((......))))..(((((((((......((((((((((((((....))))))))))))))......(((((...(((((..........)))))....)))))..)))))))))...)))).))).)))...((((((((((((.((.(((......))).)).)))))))..))))).)))))))))..))..)))))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(,(((,{((,,,,,,,|||||}.||,..,||},((((.((({,,,((.((..((((((((((....))))).))).)),.)).)).)))),)))),}.|}|.,((((((((((((((..(((.(((((((.....((.((((((((((((((((...((((.((....)))))).))))..........(((((....(((..(((((.....))))).))).(((.(((((..((((((((((({(((((((((((((((({({,.((((...(((((((((..................))))))))))))).))),..}}}((((((...))))))..,,(((.{{.,{(((((....(((((...((((((((((((((.....(((((......)))))..((((((((.(.(.((.((((.....)))))).)}}))))))))))))))))))},)))...))).))..,...)))))))).))))),})).)))))))).}.))).....)))))))).))))))))..))))){(((((,({.....{{{.((((((((....,,..((((.((((((((.,({..((.(((((((....)))))))))..)},,))))))))..))))(((((.....)))))..(((.......))){{((((((.....}}}}}}|||..(((((((.,..((((((.(((........)))))))))....))))))),..|||({((({{((((......))))......,,}))))))...)})))))))),})}}},)))))}((((((...(((((((({((.,{{({,((({{.,,....,,,...,},....,......,))})),)}.,.,...}}}}}.............)))))))))))).((.(((.((((((.(((((((((.((((,{((((((..,{......,}((((((((((.....))))))))))....((((((.(((((.(((....)))((((((...)))))).((((.....)))).((((((.......{{((.((.(((((((.....))))))).))...))))))))))..((((((.((........)).))))))(((((((((((((((((((((.(((((((((....))),....(((((((((((..((((((((({.......,((({{...((.((((((...{{((,,.((((.{{.,{{,,......|..........|||{{{{.{{.{((((((..(((((.(((..((((....))))..).)).)))))...))}})))),}))}})))}})),}))})))))).)).,,((((((...(((....,,,(((((.((.(((((.(((.(((((....{(((.((({,{.,},))))....{(((.({{{{{...|{}|||,.....}.}},))))),))}.))}}...,,,..,.((((.(((((((((.{..(((,.((((,..{{((({{,,,,...(({{{.....,))))},,,}}})).)))).}}}).||,...,.,}}..)))..,.))))))))).)))),),..)))))))).))))}.))))))).,,,.,.))),,.))))))))))))))).))))))....{(((....((({....))))..(((((.((((....)))).))))).(((((..(((..........)))..)))))(((((((((((((..{(,,,...({{((((,........((((......)))),{.((((((((((((((((,(((((.....)))))|||,,..{{{{....((((.....})))..{{(((,..((({{.....,||}}||},}|},..(((.((((({....})).))).))){((((..((((((.((((((((,,(((((.((((((((((.(((...((((((((.(((((((..(((((((............(((((({{.....,.((......))))))))))({.......,,|,..((((((......)))).)).......))))))))))))((((...((((((((.........{((.,((((.(..((........))..).)))).),..)},......))))))))..))))....)).))))))))((((({.......(((((((........)))))))......(((((((((.((((({(({,,...,},..((((((((((.....((((((((((((...,.....(((........))).{{{({.(((((....))))}.,,)))).))))))))},)))...,{{,......,}||{,{{|...,))))),...)))),,))))).........................................)))))..{...(((({.(((..,(.{(((,,,,,.{{{{|,,,)))}),...}))),.))).,))))||.,.......(((((,,....,,)))))..))))))))){((((((........)))))))((((((.((((((....)))))).))))))..})))))....((((((((((((((((((((....))))))},))......))))))))))).....(((((((((((,,,.(((((((((((.(((.,,....{{{...}}}.....))))))))))))))|||,.........,,|,,,{,,..,,,{((((((..,{.....}}.}}}}|}.,,|,},..,}}...,..,.(((((((((....((((((..(((((((((((((((((....))))))))),,.,.((((((({||{{.,,,,....|}}}.,.(({{{(((((......,{({{(((....))))))|(((..(((((({..,........)))))))..))),..))))))))),,,|||}})))}}}.{{{..,.|,,.,,,{..,,))))}}...)))))))).)))))))))))))))....,{{.{{.{{{({{{{{....,..})))))))}.)),)}}(((.,..(((((((......(((........)))......)))))))....)))..))))))).))))))).))))))))))))))}......{{{.....))))))))))))))))).))))}{{,....,)}}||,((({....)))).,},......,,({((((((.(((((({.,.,,,....((((........(((((((.((((.(((((((.((((.(((...((((((({{{(((((((((((((((....((((((((((((....((((((...,{{,.....}}}}))))))))))))))))))..............{(((((({(((....)))..}))))))}......)))))))))))))))..((((((((........))))))))((((((({,..,(((.((((((........)))))).)))}...,||.(((((({.{{{,................,,}))),)}}}}}}.|,...{{{{,(((((,,((((...((,(((((((((((((((((..,{{..,(((((...,}},,...))}......................(((((((((((.....(((((.(((((((((({{.,((.((((,,,(((((.(((((.((((((...((((((...)))))).........({(((((((...{({,,.,,,,.)}}}}}}}}.,,.((((((....)))))),,|{{((((((,{,......,,,},|{||,{||{{{,,,,,........,.......{((((((((..,..,........},,.)))))))}}...,,}}|,,.(((.((((.(((((..((((..((((..((((((......(((({.(((({{{..,,,)}}}}}}.....{(({...))}},.(((((((((((.(((.....(((..(((((((((..(((.....)))..)))))))))..))).........(((((((.(...((((({....,(((((({..,{{....}}))))))))))))).).)))))))........))).))))))}})))).........)))))....))))))..))))..))))....))))))))).))).,,{{{{{||,,||||{.{{|........((((((....)))))).......)))..)))))))))}})},.}))))).))))).))))},,{,.......(((((((((..((((((......))))))..))))))))).,|||,......{((......))){((((((((.((((.((((,((((((({...,},)}))}}((((((...,,,,{(({((({({,.......,,{,,,..,,},,.}}))}|.....,{,.....,||,,,,||,...,,}},)))))}}}}}))))))..,.)))).))))...))))))))|,{.....,,.,,}}})}},..))))}},,)}})))))))))))))))....)))))))))))..{((((..........))))}...,,,..........,{((.{(((...)))).)),..(((((((.......((((.{{(,,((({{...}}})),)))))))...,.))))))).))))))))),.....))))))))})..)))))},)),.}})))))))|{{{,.{..(((((((((.(((((((((...........(((((((..{{{......}}}...))))))).....))))}(((((((((........))))))))),...(((((((((......)))))))))....,((((......))))}...)))).))))))))),,||||||))))}}..}))}}....)))))).))).)))).))))))))))){{{(,,,,..}}))},....))))))).....)))).|||.|{{....))}....,.,(({((((((((.((......)).)))))))),)))})))).)).)))))))),.,{(((((,(((..{{((,,,.....))))..}}}.)))))))))}..,||,|((((......((((........(((((((((.....((..(((......))).))....)))))))))))))......))))),),))))).))).....)))))..,..}))))))})..)))))))))))))....))}})))))))))))......(((..(((......)))..)))(((((({......})))))){((.((((((........(((((....))))).......)))))).))|((((((....)))....}}||(({(((((((({{,...((((((......))))))...}}},...((((.(((({{{(((.((((((((.......)).)))))))))))).)))).))))...})))))).)))}(((((((((.....((((((....))))))..))))))))).})))))...)))))))))))).)).)))))))....(((((((((.{(({.....{{{.|,||((((...((((.({....((((({...})))))((((((..((((.(((((({(((,.....}}||,.,.{(((((((((((((((..{,.....,,)))))))))))))))|{|.|||,,{{,..|}|((,,{{{,,,,.......},,,}}}))}),,)),,..{((((((........))))))}((((((..((((((((((..((..((.......((((((((((((((...,,,((({....{{..{{{,(((((((({{({.,.,,,((((({....{{{||,,|||{{||...,}|}|||(({......}))))))|,..,.)))}}}....,,,}}}}{((((((((((((...(((........)))..)))))))))}})}}......,,,....,,,....{{{{...)))},,,..{{{{..,...,,},.,.,{((.(((((((((((((((.{............((((((((((((...............)))),))))))))............).))))))))).)))))))))))))))))..|||...,.})}...)).)).,,,..))))))))))))))..))..))..))))))))))..))))))|{{{|{{{,.,{{{{{({,{{{{{{(({,,..,,,,,..,,}},,.,}}}}}))).)))}))}}}..,)))......(((((....)))))}))))).))))..)))))).......((((((((((.......,.)))}(((((....))))),)))))).)).))))...)))).}}.|.|||....,,)}}}.)))))))))))))))))))).))))..)))))))..))))))))).))))))..))).)).....)).))))))))))))....{(((((..(((((((..,,({...,.{{.....}),}.}})))))))....)))))}.......))))))).)))..)))))))...{(((((......)))))}(((.({{{{....,}},}},}}},.(((((((((({..(((((((((....(((((((({,((...,.,,,,.((((,.({(({..(((((.(((({......{(((((......)))))))))))))))).||..((((((....)))))).{{{(........}})}...}))))..))}|((((((..{......}..)))))),(((((((((((((,((.(..((((((....,.((((((,....,(((..(((((...((((((((((....))))),(((.((...(((((....}))))....)).))).....})))))))))..)))}.......((((((((.(({,...}))).)))))))).{{{{{({...}}}}}}}....|,.....,.,.,)),....)))))).,,...))))))..).))))))))))))))))))))))))))..))))))))),,{{{{({,((..,,.|||||,....,.,|||,,,,||,,,,,..,}),}},,|||||,,..,,..((((((((((((((....))))))))))))))......{{{{{...(((((..........)))))....})))).,,...)))))))))))..))).))))..,,,{((((((((.((.(((......))).)).)))))))}.})))),}}||||}||,,||..,}}|||.,.......,,||,.,..},)),}}}},.
Summary
Predicted to enable DNA binding activity and metal ion binding activity. Predicted to be located in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
