Basic Information
Symbol
ZEB1
RNA Class
mRNA
Alias
zinc finger E-box binding homeobox 1
BZP
ZEB
AREB6
NIL-2-A
Zfhep
Zfhx1a
FECD6
transcription factor 8 (represses interleukin 2 expression)
posterior polymorphous corneal dystrophy 3
DELTAEF1
NIL2A
PPCD3
TCF8
zinc finger E-box-binding homeobox 1
delta-crystallin enhancer binding factor 1
negative regulator of IL2
zinc finger homeodomain enhancer-binding protein
Zinc finger E-box-binding homeobox 1
NIL-2-A zinc finger protein
Negative regulator of IL2
Transcription factor 8
TCF-8
Location (GRCh38)
10:31318495-31529814
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001174096.2
Sequence length
5937 nt
GC Content
0.3894
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1445.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1566.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1398.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Summary
This gene encodes a zinc finger transcription factor. The encoded protein likely plays a role in transcriptional repression of interleukin 2. Mutations in this gene have been associated with posterior polymorphous corneal dystrophy-3 and late-onset Fuchs endothelial corneal dystrophy. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Mar 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
