Basic Information
Symbol
ZFR
RNA Class
mRNA
Alias
zinc finger RNA binding protein
ZFR1
SPG71
zinc finger RNA-binding protein
M-phase phosphoprotein homolog
Zinc finger RNA-binding protein
hZFR
Location (GRCh38)
5:32354350-32444761
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_016107.5
Sequence length
4717 nt
GC Content
0.4200
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1329.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1423.75 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1305.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
This gene encodes an RNA-binding protein characterized by its DZF (domain associated with zinc fingers) domain. The encoded protein may play a role in the nucleocytoplasmic shuttling of another RNA-binding protein, Staufen homolog 2, in neurons. Expression of this gene is regulated through alternative polyadenylation that mediates differential microRNA targeting. Elevated expression of this gene has been observed in human patients with pancreatic cancer and knockdown of this gene may result in reduced viability and invasion of pancreatic cancer cells. [provided by RefSeq, Sep 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
