Basic Information

Symbol
BPIFB1
RNA Class
mRNA
Alias
BPI fold containing family B member 1 dJ1187J4.1 MGC14597 bA49G10.6 LPLUNC1 VEMSGP von Ebner minor salivary gland protein chromosome 20 open reading frame 114 C20orf114 BPI fold-containing family B member 1 long palate, lung and nasal epithelium carcinoma associated 1 long palate, lung and nasal epithelium carcinoma-associated protein 1 Long palate, lung and nasal epithelium carcinoma-associated protein 1
Location (GRCh38)
20:33273480-33310380 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_033197.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_033197.3
Sequence length
1641 nt
GC Content
0.5545

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-602.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -627.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_033197.3 GGGAGAGGAGAGGAGCGGGCCGAGGACUCCAGCGUGCCCAGGUCUGGCA… 1641 nt 0.5545
Summary

The protein encoded by this gene may be involved in the innate immune response to bacterial exposure in the mouth, nasal cavities, and lungs. The encoded protein is secreted and is a member of the BPI/LBP/PLUNC protein superfamily. This gene is found with other members of the superfamily in a cluster on chromosome 20. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image