Basic Information

Symbol
C5AR1
RNA Class
mRNA
Alias
complement C5a receptor 1 C5A C5AR CD88 complement component 5 receptor 1 (C5a ligand) complement component 5a receptor 1 C5R1 C5a anaphylatoxin chemotactic receptor 1 C5a anaphylatoxin receptor C5a ligand C5a-R C5a anaphylatoxin chemotactic receptor C5aR CD88 antigen
Location (GRCh38)
19:47290023-47322066 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001736.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001736.4
Sequence length
2324 nt
GC Content
0.5112

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-767.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -808.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 559.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001736.4 ACCUUCGAUCCUCGGGGAGCCCAGGAGACCAGAACAUGGACUCCUUCAA… 2324 nt 0.5112
Summary

Enables G protein-coupled receptor activity and complement component C5a receptor activity. Involved in several processes, including complement component C5a signaling pathway; mRNA transcription by RNA polymerase II; and positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade. Located in apical part of cell and basolateral plasma membrane. Biomarker of Alzheimer's disease; asthma; chronic obstructive pulmonary disease; rhinitis; and severe acute respiratory syndrome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image