Basic Information
Symbol
CA6
RNA Class
mRNA
Alias
carbonic anhydrase 6
carbonic anhydrase VI
CA-VI
GUSTIN
carbonate dehydratase VI
salivary carbonic anhydrase
secreted carbonic anhydrase
Carbonic anhydrase 6
Carbonate dehydratase VI
Carbonic anhydrase VI
Salivary carbonic anhydrase
Secreted carbonic anhydrase
EC 4.2.1.1
Location (GRCh38)
1:8945867-8975092
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001215.4
Sequence length
1334 nt
GC Content
0.4985
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-400.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-427.14 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
354.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001215.4 | AUUACAGAUGUGCAGCACCAUGAGGGCCCUGGUGCUUCUGCUGUCCCUG… | 1334 nt | 0.4985 |
| NM_001270500.2 | AUUACAGAUGUGCAGCACCAUGAGGGCCCUGGUGCUUCUGCUGUCCCUG… | 961 nt | 0.5525 |
| NM_001270501.2 | AUUACAGAUGUGCAGCACCAUGAGGGCCCUGGUGCUUCUGCUGUCCCUG… | 1154 nt | 0.4827 |
| NM_001270502.2 | AUUACAGAUGUGCAGCACCAUGAGGGCCCUGGUGCUUCUGCUGUCCCUG… | 1005 nt | 0.4667 |
Summary
The protein encoded by this gene is one of several isozymes of carbonic anhydrase. This protein is found only in salivary glands and saliva and protein may play a role in the reversible hydratation of carbon dioxide though its function in saliva is unknown. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
