Basic Information
Symbol
CACNA1C
RNA Class
mRNA
Alias
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C
Cav1.2
CACH2
CACN2
TS
LQT8
calcium channel, voltage-dependent, L type, alpha 1C subunit
CACNA1C intronic transcript 2
CACNA1C intronic transcript 2 (non-protein coding)
CACNA1C-IT2
CACNL1A1
CCHL1A1
NEDHLSS
TS. LQT8
voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C
DHPR, alpha-1 subunit
calcium channel, cardic dihydropyridine-sensitive, alpha-1 subunit
voltage-dependent L-type Ca2+ channel alpha 1 subunit
Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C
Calcium channel, L type, alpha-1 polypeptide, isoform 1, cardiac muscle
Voltage-gated calcium channel subunit alpha Cav1.2
Location (GRCh38)
12:1970772-2697950
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_000719.7
Sequence length
13744 nt
GC Content
0.5291
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4942.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-5184.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
3844.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
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|---|---|---|---|
| NM_001167624.3 | GUCUCCCUCUCGCUGCCUCUGCAGAAACAGCUCCUGCCAGAGCGGCGCU… | 13849 nt | 0.5296 |
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| NM_199460.4 | GUCUCCCUCUCGCUGCCUCUGCAGAAACAGCUCCUGCCAGAGCGGCGCU… | 13993 nt | 0.5278 |
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Summary
This gene encodes an alpha-1 subunit of a voltage-dependent calcium channel. Calcium channels mediate the influx of calcium ions into the cell upon membrane polarization. The alpha-1 subunit consists of 24 transmembrane segments and forms the pore through which ions pass into the cell. The calcium channel consists of a complex of alpha-1, alpha-2/delta, beta, and gamma subunits in a 1:1:1:1 ratio. There are multiple isoforms of each of these proteins, either encoded by different genes or the result of alternative splicing of transcripts. The protein encoded by this gene binds to and is inhibited by dihydropyridine. Alternative splicing results in many transcript variants encoding different proteins. Some of the predicted proteins may not produce functional ion channel subunits. [provided by RefSeq, Oct 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
