Basic Information
Symbol
CADPS2
RNA Class
mRNA
Alias
calcium dependent secretion activator 2
CAPS2
Ca++-dependent activator protein for secretion 2
Ca2+ dependent secretion activator 2
calcium-dependent secretion activator 2
CAPS-2
Ca++-dependent secretion activator 2
Ca2+-dependent activator protein for secretion 2
calcium-dependent activator protein for secretion 2
KIAA1591
Calcium-dependent secretion activator 2
Calcium-dependent activator protein for secretion 2
Location (GRCh38)
7:122318411-122886779
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_017954.11
Sequence length
5768 nt
GC Content
0.4209
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1631.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1740.49 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1655.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001363397.2 | AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… | 5639 nt | 0.4206 |
| NM_001363398.2 | AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… | 5630 nt | 0.4206 |
| NM_001363399.2 | AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… | 5841 nt | 0.4215 |
| NM_001363400.2 | AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… | 5721 nt | 0.4214 |
| NM_017954.11 | AGUUUUCCUUUCGUUCUGCGGCCGCUGCAGCCAGCCCCGCGGCUCCCUC… | 5768 nt | 0.4209 |
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary
This gene encodes a member of the calcium-dependent activator of secretion (CAPS) protein family, which are calcium binding proteins that regulate the exocytosis of synaptic and dense-core vesicles in neurons and neuroendocrine cells. Mutations in this gene may contribute to autism susceptibility. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2009]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
