Basic Information

Symbol
CAPRIN1
RNA Class
mRNA
Alias
cell cycle associated protein 1 caprin-1 RNG105 cytoplasmic activation/proliferation-associated protein-1 membrane component, chromosome 11, surface marker 1 GPI-anchored membrane protein 1 CONDCAC GPIAP1 GPIP137 GRIP137 M11S1 NEDLAAD p137GPI GPI-anchored protein p137 GPI-p137 RNA granule protein 105 activation/proliferation-associated protein 1 caprin 1 cytoplasmic activation- and proliferation-associated protein 1 membrane component chromosome 11 surface marker 1 Caprin-1 Cell cycle-associated protein 1 Cytoplasmic activation- and proliferation-associated protein 1 Membrane component chromosome 11 surface marker 1
Location (GRCh38)
11:34051674-34102610 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_005898.5
BLAST PRIMER
NM_203364.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_005898.5
Sequence length
5514 nt
GC Content
0.4153

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1524.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1631.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1631.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_005898.5 CACUAGGAGCGGCUCUCGGUGCAGCGGGACAGGGCGAAGCGGCCUGCGC… 5514 nt 0.4153
NM_203364.3 CACUAGGAGCGGCUCUCGGUGCAGCGGGACAGGGCGAAGCGGCCUGCGC… 3505 nt 0.4368
Summary

Enables several functions, including ATP binding activity; molecular condensate scaffold activity; and signaling adaptor activity. Involved in non-membrane-bounded organelle assembly; positive regulation of stress granule assembly; and regulation of gene expression. Located in cell leading edge and cytosol. Is active in intracellular non-membrane-bounded organelle. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image