Basic Information
Symbol
CASC4
RNA Class
mRNA
Alias
golgi membrane protein 2
H63
DKFZp459F1927
cancer susceptibility candidate 4
cancer susceptibility 4
CASC4
protein GOLM2
cancer susceptibility candidate gene 4 protein
gene associated with HER-2/neu overexpression
protein CASC4
Protein GOLM2
Cancer susceptibility candidate gene 4 protein
Golgi membrane protein 2
Location (GRCh38)
15:44288699-44415758
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_138423.4
Sequence length
3974 nt
GC Content
0.4084
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1089.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1170.45 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1054.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary
The increased expression level of this gene is associated with HER-2/neu proto-oncogene overexpression. Amplification and resulting overexpression of this proto-oncogene are found in approximately 30% of human breast and 20% of human ovarian cancers. Alternatively spliced variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
