Basic Information

Symbol
CASC4
RNA Class
mRNA
Alias
golgi membrane protein 2 H63 DKFZp459F1927 cancer susceptibility candidate 4 cancer susceptibility 4 CASC4 protein GOLM2 cancer susceptibility candidate gene 4 protein gene associated with HER-2/neu overexpression protein CASC4 Protein GOLM2 Cancer susceptibility candidate gene 4 protein Golgi membrane protein 2

Secondary Structure

MANE Select
NM_138423.4
Sequence length
3974 nt
GC Content
0.4084

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1089.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1170.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1054.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Summary

The increased expression level of this gene is associated with HER-2/neu proto-oncogene overexpression. Amplification and resulting overexpression of this proto-oncogene are found in approximately 30% of human breast and 20% of human ovarian cancers. Alternatively spliced variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image