Basic Information
Symbol
CASP1
RNA Class
mRNA
Alias
caspase 1
ICE
caspase-1
interleukin 1, beta, convertase
caspase 1, apoptosis-related cysteine protease (interleukin 1, beta, convertase)
caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase (interleukin 1, beta, convertase)
caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase
IL1BC
P45
IL-1 beta-converting enzyme
IL1B-convertase
interleukin 1-B converting enzyme
IL1BCE
Caspase-1
CASP-1
Interleukin-1 beta convertase
IL-1BC
Interleukin-1 beta-converting enzyme
p45
EC 3.4.22.36
EC 3.4.22
Location (GRCh38)
11:105023581-105035250
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001257118.3
Sequence length
1996 nt
GC Content
0.4108
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-536.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-579.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
442.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001223.5 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1373 nt | 0.4385 |
| NM_001257118.3 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1996 nt | 0.4108 |
| NM_001257119.3 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1933 nt | 0.4123 |
| NM_033292.4 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1436 nt | 0.4352 |
| NM_033293.4 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1157 nt | 0.4382 |
| NM_033294.4 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 1013 nt | 0.4403 |
| NM_033295.4 | CAGUCACACAAGAAGGGAGGAGAGAAAAGCCAUGGCCGACAAGGUCCUG… | 488 nt | 0.4078 |
Summary
This gene encodes a protein which is a member of the cysteine-aspartic acid protease (caspase) family. Sequential activation of caspases plays a central role in the execution-phase of cell apoptosis. Caspases exist as inactive proenzymes which undergo proteolytic processing at conserved aspartic residues to produce 2 subunits, large and small, that dimerize to form the active enzyme. This gene was identified by its ability to proteolytically cleave and activate the inactive precursor of interleukin-1, a cytokine involved in the processes such as inflammation, septic shock, and wound healing. This gene has been shown to induce cell apoptosis and may function in various developmental stages. Studies of a similar gene in mouse suggest a role in the pathogenesis of Huntington disease. Alternative splicing results in transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2012]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
