Basic Information

Symbol
CASP3
RNA Class
mRNA
Alias
caspase 3 CPP32 CPP32B Yama apopain caspase 3, apoptosis-related cysteine protease caspase 3, apoptosis-related cysteine peptidase SCA-1 caspase-3 CASP-3 CPP-32 PARP cleavage protease SREBP cleavage activity 1 cysteine protease CPP32 procaspase3 protein Yama Caspase-3 Apopain Cysteine protease CPP32 Protein Yama EC 3.4.22.56 EC 3.4.22
Location (GRCh38)
4:184627695-184650418 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001354777.2
BLAST PRIMER
NM_001354779.2
BLAST PRIMER
NM_001354780.2
BLAST PRIMER
NM_001354781.2
BLAST PRIMER
NM_001354782.2
BLAST PRIMER
NM_001354783.2
BLAST PRIMER
NM_001354784.2
BLAST PRIMER
NM_004346.4
BLAST PRIMER
NM_032991.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_004346.4
Sequence length
2645 nt
GC Content
0.3943

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-703.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -756.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 652.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001354779.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2474 nt 0.3804
NM_001354780.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2641 nt 0.3945
NM_001354781.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2357 nt 0.3734
NM_001354782.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2524 nt 0.3887
NM_001354783.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2716 nt 0.3951
NM_001354784.2 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2353 nt 0.3736
NM_004346.4 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2645 nt 0.3943
NM_032991.3 AGUGCAGACGCGGCUCCUAGCGGAUGGGUGCUAUUGUGAGGCGGUUGUA… 2478 nt 0.3801
Summary

The protein encoded by this gene is a cysteine-aspartic acid protease that plays a central role in the execution-phase of cell apoptosis. The encoded protein cleaves and inactivates poly(ADP-ribose) polymerase while it cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins as well as caspases 6, 7, and 9. This protein itself is processed by caspases 8, 9, and 10. It is the predominant caspase involved in the cleavage of amyloid-beta 4A precursor protein, which is associated with neuronal death in Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image