Basic Information

Symbol
CATSPER4
RNA Class
mRNA
Alias
cation channel sperm associated 4 cation channel, sperm associated 4 cation channel sperm-associated protein 4 ion channel CatSper4 Cation channel sperm-associated protein 4 CatSper4
Location (GRCh38)
1:26190561-26202968 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_198137.2
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_198137.2
Sequence length
1867 nt
GC Content
0.5501

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-700.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -730.7 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 459.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_198137.2 GAGGAGAAGGAAGAGACUGAGCAAACAUGAGGGAUAAUGAAAAGGCCUG… 1867 nt 0.5501
Summary

Predicted to enable voltage-gated calcium channel activity. Predicted to be involved in flagellated sperm motility; sodium ion transport; and sperm capacitation. Predicted to act upstream of or within establishment of localization in cell. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be part of CatSper complex. Predicted to be active in acrosomal vesicle and sperm principal piece. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image